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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
期刊论文
CELL RESEARCH, 2024, 页码: 16
作者:
Yang, Xiaodong
;
Liu, Guole
;
Feng, Guihai
;
Bu, Dechao
;
Wang, Pengfei
;
Jiang, Jie
;
Chen, Shubai
;
Yang, Qinmeng
;
Miao, Hefan
;
Zhang, Yiyang
;
Man, Zhenpeng
;
Liang, Zhongming
;
Wang, Zichen
;
Li, Yaning
;
Li, Zheng
;
Liu, Yana
;
Tian, Yao
;
Liu, Wenhao
;
Li, Cong
;
Li, Ao
;
Dong, Jingxi
;
Hu, Zhilong
;
Fang, Chen
;
Cui, Lina
;
Deng, Zixu
;
Jiang, Haiping
;
Cui, Wentao
;
Zhang, Jiahao
;
Yang, Zhaohui
;
Li, Handong
;
He, Xingjian
;
Zhong, Liqun
;
Zhou, Jiaheng
;
Wang, Zijian
;
Long, Qingqing
;
Xu, Ping
;
Wang, Hongmei
;
Meng, Zhen
;
Wang, Xuezhi
;
Wang, Yangang
;
Wang, Yong
;
Zhang, Shihua
;
Guo, Jingtao
;
Zhao, Yi
;
Zhou, Yuanchun
;
Li, Fei
;
Liu, Jing
;
Chen, Yiqiang
;
Yang, Ge
;
Li, Xin
收藏
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浏览/下载:4/0
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提交时间:2024/12/06
GCSA: A New Adversarial Example-Generating Scheme Toward Black-Box Adversarial Attacks
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON CONSUMER ELECTRONICS, 2024, 卷号: 70, 期号: 1, 页码: 2038-2048
作者:
Fan, Xinxin
;
Li, Mengfan
;
Zhou, Jia
;
Jing, Quanliang
;
Lin, Chi
;
Lu, Yunfeng
;
Bi, Jingping
收藏
  |  
浏览/下载:2/0
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提交时间:2024/12/06
Closed box
Perturbation methods
Predictive models
Indexes
Training
Glass box
Optimization
Deep learning
adversarial examples
black-box adversarial attack
transferability
Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics*
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:
Zhou Wen-Jing
;
Zeng Wen-Feng
;
Chi Hao
;
He Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:16/0
  |  
提交时间:2023/12/04
proteomics
mass spectrometry
target-decoy approach
false discovery rate
validation methods
Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics br
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:36/0
  |  
提交时间:2023/12/04
proteomics
mass spectrometry
target-decoy approach
false discovery rate
validation methods
蛋白质组学肽段鉴定可信度评价方法
期刊论文
生物化学与生物物理进展, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109
作者:
周文婧
;
曾文锋
;
迟浩
;
贺思敏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
proteomics
mass spectrometry
target-decoy approach
false discovery rate
validation methods
蛋白质组学
质谱分析
目标-诱饵库方法
假发现率
可信度评价方法
Microbiome Resilience and Health Implications for People in Half-Year Travel
期刊论文
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2022, 卷号: 13, 页码: 15
作者:
Cheng, Mingyue
;
Liu, Hong
;
Han, Maozhen
;
Li, Shuai Cheng
;
Bu, Dongbo
;
Sun, Shiwei
;
Hu, Zhiqiang
;
Yang, Pengshuo
;
Wang, Rui
;
Liu, Yawen
;
Chen, Feng
;
Peng, Jianjun
;
Peng, Hong
;
Song, Hongxing
;
Xia, Yang
;
Chu, Liqun
;
Zhou, Quan
;
Guan, Feng
;
Wu, Jing
;
Tan, Guangming
;
Ning, Kang
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浏览/下载:37/0
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提交时间:2022/12/07
travel
enterotype
microbiome
bi-directional plasticity
resilience
dietary shift
immunity
health
pValid 2: A deep learning based validation method for peptide identification in shotgun proteomics with increased discriminating power
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOMICS, 2022, 卷号: 251, 页码: 9
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Wei, Zhuo-Hong
;
He, Si-Min
;
Chi, Hao
收藏
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浏览/下载:41/0
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提交时间:2022/06/21
Proteomics
Tandem mass spectrometry
Retention time
Validation method
Deep learning
Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D18-D28
作者:
Xue, Yongbiao
;
Bao, Yiming
;
Zhang, Zhang
;
Zhao, Wenming
;
Xiao, Jingfa
;
He, Shunmin
;
Zhang, Guoqing
;
Li, Yixue
;
Zhao, Guoping
;
Chen, Runsheng
;
Song, Shuhui
;
Ma, Lina
;
Zou, Dong
;
Tian, Dongmei
;
Li, Cuiping
;
Zhu, Junwei
;
Gong, Zheng
;
Chen, Meili
;
Wang, Anke
;
Ma, Yingke
;
Li, Mengwei
;
Teng, Xufei
;
Cui, Ying
;
Duan, Guangya
;
Zhang, Mochen
;
Jin, Tong
;
Shi, Chengmin
;
Du, Zhenglin
;
Zhang, Yadong
;
Liu, Chuandong
;
Li, Rujiao
;
Zeng, Jingyao
;
Hao, Lili
;
Jiang, Shuai
;
Chen, Hua
;
Han, Dali
;
Yongbiao, Xue
;
Zhang, Tao
;
Kang, Wang
;
Qu, Jing
;
Zhang, Weiqi
;
Liu, Guang-Hui
;
Liu, Lin
;
Zhang, Yang
;
Niu, Guangyi
;
Zhu, Tongtong
;
Feng, Changrui
;
Liu, Xiaonan
;
Zhang, Yuansheng
;
Li, Zhao
;
Chen, Ruru
;
Li, Qianpeng
;
Hua, Zhongyi
;
Jiang, Chao
;
Chen, Ziyuan
;
He, Fangshu
;
Zhao, Yuyang
;
Jin, Yan
;
Huang, Luqi
;
Yuan, Yuan
;
Zhou, Chenfen
;
Xu, Qingwei
;
He, Sheng
;
Ye, Wei
;
Cao, Ruifang
;
Wang, Pengyu
;
Ling, Yunchao
;
Yan, Xing
;
Wang, Qingzhong
;
Du, Qiang
;
Zong, Wenting
;
Kang, Hongen
;
Xiong, Zhuang
;
Huan, Wendi
;
Zhang, Sirui
;
Xia, Qiguang
;
Fan, Xiaojuan
;
Wang, Zefeng
;
Chen, Xu
;
Chen, Tingting
;
Zhang, Sisi
;
Tang, Bixia
;
Dong, Lili
;
Zhang, Zhewen
;
Wang, Zhonghuang
;
Kang, Hailong
;
Wang, Yanqing
;
Wu, Song
;
Wang, Honggen
;
Chen, Ming
;
Liu, Chang
;
Xiong, Yujia
;
Shao, Xueying
;
Li, Yanyan
;
Zhou, Honghong
;
Chen, Xiaomin
;
Zheng, Yu
;
Kang, Quan
;
Hao, Di
;
Zhang, Lili
;
Luo, Huaxia
;
Hao, Yajing
;
Zhang, Peng
;
Nie, Zhi
;
Yu, Shuhuan
;
Yang, Fei
;
Sang, Jian
;
Li, Zhaohua
;
Zhang, Xiangquan
;
Zhou, Qing
;
Zhai, Shuang
;
Zhang, Yaping
;
Wang, Guodong
;
Zhu, Qianghui
;
Li, Xin
;
Li, Menghua
;
Yan, Jun
;
Li, Chen
;
Wang, Zhennan
;
Wang, Xiangfeng
;
Liu, Yuanming
;
Luo, Hong
;
Wu, Xiaoyuan
;
Jing, HaiChun
;
Song, Tinrui
;
Zhao, Yi
;
Mehmood, Furrukh
;
Ali, Shahid
;
Ali, Amjad
;
Saleem, Shoaib
;
Hussain, Irfan
;
Abbasi, Amir A.
;
Zuo, Zhixiang
;
Ren, Jian
;
Zhang, Xinxin
;
Xiao, Yun
;
Li, Xia
;
Tu, Yiran
;
Xue, Yu
;
Wu, Wanying
;
Ji, Peifeng
;
Zhao, Fangqing
;
Meng, Xianwen
;
Peng, Di
;
Luo, Hao
;
Gao, Feng
;
Ning, Wanshan
;
Lin, Shaofeng
;
Liu, Teng
;
Guo, An-Yuan
;
Yuan, Hao
;
Zhang, Yong E.
;
Tan, Xiaodan
;
Zhang, Weizhi
;
Xie, Yubin
;
Wang, Chenwei
;
Liu, Chun-Jie
;
Yang, De-Chang
;
Tian, Feng
;
Gao, Ge
;
Tang, Dachao
;
Yao, Lan
;
Cui, Qinghua
;
An, Ni A.
;
Li, Chuan-Yun
;
Luo, XiaoTong
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提交时间:2021/12/01
A mobile services recommendation system fuses implicit and explicit user trust relationships
期刊论文
JOURNAL OF AMBIENT INTELLIGENCE AND SMART ENVIRONMENTS, 2021, 卷号: 13, 期号: 1, 页码: 21-35
作者:
Luo, Pengcheng
;
Zhang, Jilin
;
Wan, Jian
;
Zhao, Nailiang
;
Ren, Zujie
;
Zhou, Li
;
Shen, Jing
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提交时间:2021/12/01
Collaborative filtering
data management
data mining
matrix factorization
recommendation system
social network
Resilience of human gut microbial communities for the long stay with multiple dietary shifts
期刊论文
GUT, 2019, 卷号: 68, 期号: 12, 页码: 2254-+
作者:
Liu, Hong
;
Han, Maozhen
;
Li, Shuai Cheng
;
Tan, Guangming
;
Sun, Shiwei
;
Hu, Zhiqiang
;
Yang, Pengshuo
;
Wang, Rui
;
Liu, Yawen
;
Chen, Feng
;
Peng, Jianjun
;
Peng, Hong
;
Song, Hongxing
;
Xia, Yang
;
Chu, Liqun
;
Zhou, Quan
;
Guan, Feng
;
Wu, Jing
;
Bu, Dongbo
;
Ning, Kang
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提交时间:2020/12/10