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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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MarkerDetector: A method for robust fiducial marker detection in electron micrographs using wavelet-based template
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2024, 卷号: 216, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Hou, Gaoxin
;
Yang, Zhidong
;
Zang, Dawei
;
Fernandez, Jose-Jesus
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
收藏
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浏览/下载:13/0
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提交时间:2024/05/20
Electron microscopy
Wavelet transform
Template matching
Fiducial marker detection
AuTom: A novel automatic platform for electron tomography reconstruction
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 199, 期号: 3, 页码: 196-208
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Wang, Zihao
;
Hao, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Chen, Yu
;
Gao, Xin
;
Liu, Zhiyong
;
Ren, Fei
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography
Alignment
Reconstruction
Image processing workflow
Electron tomography simulator with realistic 3D phantom for evaluation of acquisition, alignment and reconstruction methods
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 198, 期号: 2, 页码: 103-115
作者:
Wan, Xiaohua
;
Katchalski, Tsvi
;
Churas, Christopher
;
Ghosh, Sreya
;
Phan, Sebastien
;
Lawrence, Albert
;
Hao, Yu
;
Zhou, Ziying
;
Chen, Ruijuan
;
Chen, Yu
;
Zhang, Fa
;
Ellisman, Mark H.
收藏
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浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12
Electron
Microscope
Tomography
Simulator
Tilt
Series
Reconstruction
Tracking
Alignment
Block face
Inversion
Curvilinear
Warping
ICON: 3D reconstruction with 'missing-information' restoration in biological electron tomography
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2016, 卷号: 195, 期号: 1, 页码: 100-112
作者:
Deng, Yuchen
;
Chen, Yu
;
Zhang, Yan
;
Wang, Shengliu
;
Zhang, Fa
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:57/0
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提交时间:2019/12/13
Compressed sensing
Electron tomography
Missing wedge
NUFFT
Sub-tomogram averaging
FIRT: Filtered iterative reconstruction technique with information restoration
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2016, 卷号: 195, 期号: 1, 页码: 49-61
作者:
Chen, Yu
;
Zhang, Yan
;
Zhang, Kai
;
Deng, Yuchen
;
Wang, Shengliu
;
Zhang, Fa
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:60/0
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提交时间:2019/12/13
Algebra reconstruction technique
Electron tomography
Filtered iterative reconstruction technique
Information restoration
Nonlinear diffusion filter
A novel fully automatic scheme for fiducial marker-based alignment in electron tomography
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2015, 卷号: 192, 期号: 3, 页码: 403-417
作者:
Han, Renmin
;
Wang, Liansan
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2019/12/13
Electron tomography
Alignment
Point set registration
Four point invariant
Three-dimensional reconstruction using an adaptive simultaneous algebraic reconstruction technique in electron tomography
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2011, 卷号: 175, 期号: 3, 页码: 277-287
作者:
Wan, Xiaohua
;
Zhang, Fa
;
Chu, Qi
;
Zhang, Kai
;
Sun, Fei
;
Yuan, Bo
;
Liu, Zhiyong
收藏
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浏览/下载:70/0
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提交时间:2019/12/16
Electron tomography
Three-dimensional reconstruction
Iterative methods
ASART (adaptive simultaneous algebraic reconstruction technique)