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Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigms 期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 21, 期号: 5, 页码: 913-925
作者:  Huang, Bin;  Kong, Lupeng;  Wang, Chao;  Ju, Fusong;  Zhang, Qi;  Zhu, Jianwei;  Gong, Tiansu;  Zhang, Haicang;  Yu, Chungong;  Zheng, Wei-Mou;  Bu, Dongbo
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Protein folding  Protein structure prediction  Deep learning  Transformer  Language model  
Revolutionizing Antibody Discovery: An Innovative AI Model for Generating Robust Libraries 期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 21, 期号: 5, 页码: 910-912
作者:  Wang, Yaojun;  Sun, Shiwei
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Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics* 期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:  Zhou Wen-Jing;  Zeng Wen-Feng;  Chi Hao;  He Si-Min
收藏  |  浏览/下载：8/0  |  提交时间：2023/12/04
proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods  
Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics br 期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:  Zhou, Wen-Jing;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  He, Si-Min
收藏  |  浏览/下载：23/0  |  提交时间：2023/12/04
proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods  
A universal database reduction method based on the sequence tag strategy to facilitate large-scale database search in proteomics 期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY, 2023, 卷号: 483, 页码: 11
作者:  Wang, Kai-Fei;  Wu, Yu-Zhuo;  Chi, Hao
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蛋白质组学肽段鉴定可信度评价方法 期刊论文
生物化学与生物物理进展, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109
作者:  周文婧;  曾文锋;  迟浩;  贺思敏
收藏  |  浏览/下载：2/0  |  提交时间：2024/05/20
proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods  蛋白质组学  质谱分析  目标-诱饵库方法  假发现率  可信度评价方法  
dbDEMC 3.0: Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms 期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 20, 期号: 3, 页码: 446-454
作者:  Xu, Feng;  Wang, Yifan;  Ling, Yunchao;  Zhou, Chenfen;  Wang, Haizhou;  Teschendorff, Andrew E.;  Zhao, Yi;  Zhao, Haitao;  He, Yungang;  Zhang, Guoqing;  Yang, Zhen
收藏  |  浏览/下载：13/0  |  提交时间：2023/07/12
MicroRNA  Cancer  Differential expression  Model organism  Database  
Recent Progress in Chemical Cross-linking Coupled With Mass Spectrometry 期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2022, 卷号: 49, 期号: 4, 页码: 737-758
作者:  Chen Zhen-Lin;  Cao Yong;  He Si-Min
收藏  |  浏览/下载：18/0  |  提交时间：2022/12/07
cross-linking mass spectrometry  protein structure  protein interaction  proteomics  mass spectrometry  
Null-free False Discovery Rate Control Using Decoy Permutations 期刊论文
ACTA MATHEMATICAE APPLICATAE SINICA-ENGLISH SERIES, 2022, 卷号: 38, 期号: 2, 页码: 235-253
作者:  He, Kun;  Li, Meng-jie;  Fu, Yan;  Gong, Fu-zhou;  Sun, Xiao-ming
收藏  |  浏览/下载：22/0  |  提交时间：2022/12/07
multiple testing  false discovery rate  null distribution-free  p-value-free  decoy permutations  knockoff filter  
Radiosensitivity-Specific Proteomic and Signaling Pathway Network of Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) 期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION ONCOLOGY BIOLOGY PHYSICS, 2022, 卷号: 112, 期号: 2, 页码: 529-541
作者:  Zhu, Xueru;  Wang, Yiting;  Jiang, Chang;  Li, Xiaoyang;  Sun, Linying;  Wang, Guangzhong;  Fu, Xiaolong
收藏  |  浏览/下载：20/0  |  提交时间：2022/12/07