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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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AuTom-dualx: a toolkit for fully automatic fiducial marker-based alignment of dual-axis tilt series with simultaneous reconstruction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 2, 页码: 319-328
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Li, Lun
;
Lawrence, Albert
;
Yang, Peng
;
Li, Yu
;
Wang, Sheng
;
Sun, Fei
;
Liu, Zhiyong
;
Gao, Xin
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:81/0
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提交时间:2019/04/03
AutoGDeterm: Automatic Geometry Determination for Electron Tomography
期刊论文
TSINGHUA SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2018, 卷号: 23, 期号: 4, 页码: 369-376
作者:
Chen, Yu
;
Wang, Zihao
;
Li, Lun
;
Zhang, Jingrong
;
Wan, Xiaohua
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:79/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
geometry determination
human intervention
full automation
AutoGDeterm
comparable accuracy
FSPP: A Tool for Genome-Wide Prediction of smORF-Encoded Peptides and Their Functions
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2018, 卷号: 9, 页码: 8
作者:
Li, Hui
;
Xiao, Li
;
Zhang, Lili
;
Wu, Jiarui
;
Wei, Bin
;
Sun, Ninghui
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:72/0
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提交时间:2019/12/10
smORF
SEP
Ribo-seq
MS
function
Comprehensive Characterization of the RNA Editomes in Cancer Development and Progression
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2018, 卷号: 8, 页码: 8
作者:
Luo, Haitao
;
Fang, Shuangsang
;
Sun, Liang
;
Liu, Zhiyong
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:75/0
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提交时间:2019/12/10
post-transcriptional regulation
RNA editome
tumorigenesis
metastasis
transcriptome
Computer-Aided Detection of Pulmonary Nodules in Computed Tomography Images: Effect on Observer Performance
期刊论文
JOURNAL OF MEDICAL IMAGING AND HEALTH INFORMATICS, 2017, 卷号: 7, 期号: 6, 页码: 1205-1211
作者:
Liu, JiaBao
;
Wang, Yu
;
Zhang, Fa
;
Ren, Fei
;
Liu, LiHeng
;
He, Wen
收藏
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浏览/下载:81/0
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提交时间:2019/12/12
Computer-Aided Detection
Model Learning
Lung Nodule
Computed Tomography
AuTom: A novel automatic platform for electron tomography reconstruction
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 199, 期号: 3, 页码: 196-208
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Wang, Zihao
;
Hao, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Chen, Yu
;
Gao, Xin
;
Liu, Zhiyong
;
Ren, Fei
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography
Alignment
Reconstruction
Image processing workflow
Identification and function annotation of long intervening noncoding RNAs
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 18, 期号: 5, 页码: 789-797
作者:
Luo, Haitao
;
Bu, Dechao
;
Sun, Liang
;
Fang, Shuangsang
;
Liu, Zhiyong
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:74/0
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提交时间:2019/12/12
transcriptom sequencing
noncoding RNAs
gene identification
function annotation
network analysis
computational method
The long non-coding RNA NONHSAG026900 predicts prognosis as a favorable biomarker in patients with diffuse large B-cell lymphoma
期刊论文
ONCOTARGET, 2017, 卷号: 8, 期号: 21, 页码: 34374-34386
作者:
Zhao, Shuangtao
;
Fang, Shuangsang
;
Liu, Yanhua
;
Li, Xixi
;
Liao, Shengyou
;
Chen, Jinwen
;
Liu, Jingjia
;
Zhao, Lianhe
;
Li, Hui
;
Zhou, Wei
;
Shen, Wenzhi
;
Dong, Xiaoli
;
Xiang, Rong
;
Wang, Luhua
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:64/0
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提交时间:2019/12/12
diffuse large B-cell lymphoma
long non-coding RNA
NONHSAG026900
prognosis
biomarker
Live cell single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy
期刊论文
CELL RESEARCH, 2017, 卷号: 27, 期号: 5, 页码: 713-716
作者:
Xu, Fan
;
Zhang, Mingshu
;
He, Wenting
;
Han, Renmin
;
Xue, Fudong
;
Liu, Zhiyong
;
Zhang, Fa
;
Lippincott-Schwartz, Jennifer
;
Xu, Pingyong
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浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography simulator with realistic 3D phantom for evaluation of acquisition, alignment and reconstruction methods
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 198, 期号: 2, 页码: 103-115
作者:
Wan, Xiaohua
;
Katchalski, Tsvi
;
Churas, Christopher
;
Ghosh, Sreya
;
Phan, Sebastien
;
Lawrence, Albert
;
Hao, Yu
;
Zhou, Ziying
;
Chen, Ruijuan
;
Chen, Yu
;
Zhang, Fa
;
Ellisman, Mark H.
收藏
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浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12
Electron
Microscope
Tomography
Simulator
Tilt
Series
Reconstruction
Tracking
Alignment
Block face
Inversion
Curvilinear
Warping