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中国科学院计算技术研究所机构知识库
Institute of Computing Technology, Chinese Academy IR
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中国科学院计算技术... [11]
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Zhang, Fa [11]
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Sun, Fei [6]
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期刊论文 [11]
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2018 [1]
2017 [5]
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AutoGDeterm: Automatic Geometry Determination for Electron Tomography
期刊论文
TSINGHUA SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2018, 卷号: 23, 期号: 4, 页码: 369-376
作者:
Chen, Yu
;
Wang, Zihao
;
Li, Lun
;
Zhang, Jingrong
;
Wan, Xiaohua
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:79/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
geometry determination
human intervention
full automation
AutoGDeterm
comparable accuracy
Computer-Aided Detection of Pulmonary Nodules in Computed Tomography Images: Effect on Observer Performance
期刊论文
JOURNAL OF MEDICAL IMAGING AND HEALTH INFORMATICS, 2017, 卷号: 7, 期号: 6, 页码: 1205-1211
作者:
Liu, JiaBao
;
Wang, Yu
;
Zhang, Fa
;
Ren, Fei
;
Liu, LiHeng
;
He, Wen
收藏
  |  
浏览/下载:81/0
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提交时间:2019/12/12
Computer-Aided Detection
Model Learning
Lung Nodule
Computed Tomography
AuTom: A novel automatic platform for electron tomography reconstruction
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 199, 期号: 3, 页码: 196-208
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Wang, Zihao
;
Hao, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Chen, Yu
;
Gao, Xin
;
Liu, Zhiyong
;
Ren, Fei
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography
Alignment
Reconstruction
Image processing workflow
Live cell single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy
期刊论文
CELL RESEARCH, 2017, 卷号: 27, 期号: 5, 页码: 713-716
作者:
Xu, Fan
;
Zhang, Mingshu
;
He, Wenting
;
Han, Renmin
;
Xue, Fudong
;
Liu, Zhiyong
;
Zhang, Fa
;
Lippincott-Schwartz, Jennifer
;
Xu, Pingyong
收藏
  |  
浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography simulator with realistic 3D phantom for evaluation of acquisition, alignment and reconstruction methods
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 198, 期号: 2, 页码: 103-115
作者:
Wan, Xiaohua
;
Katchalski, Tsvi
;
Churas, Christopher
;
Ghosh, Sreya
;
Phan, Sebastien
;
Lawrence, Albert
;
Hao, Yu
;
Zhou, Ziying
;
Chen, Ruijuan
;
Chen, Yu
;
Zhang, Fa
;
Ellisman, Mark H.
收藏
  |  
浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12
Electron
Microscope
Tomography
Simulator
Tilt
Series
Reconstruction
Tracking
Alignment
Block face
Inversion
Curvilinear
Warping
A Two-Phase Improved Correlation Method for Automatic Particle Selection in Cryo-EM
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 14, 期号: 2, 页码: 316-325
作者:
Zhang, Fa
;
Chen, Yu
;
Ren, Fei
;
Wang, Xuan
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
收藏
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浏览/下载:63/0
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提交时间:2019/12/12
Particle selection
feature-based
template-matching
rotation-invariant feature
correlation score functions
ICON: 3D reconstruction with 'missing-information' restoration in biological electron tomography
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2016, 卷号: 195, 期号: 1, 页码: 100-112
作者:
Deng, Yuchen
;
Chen, Yu
;
Zhang, Yan
;
Wang, Shengliu
;
Zhang, Fa
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:57/0
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提交时间:2019/12/13
Compressed sensing
Electron tomography
Missing wedge
NUFFT
Sub-tomogram averaging
FIRT: Filtered iterative reconstruction technique with information restoration
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2016, 卷号: 195, 期号: 1, 页码: 49-61
作者:
Chen, Yu
;
Zhang, Yan
;
Zhang, Kai
;
Deng, Yuchen
;
Wang, Shengliu
;
Zhang, Fa
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:60/0
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提交时间:2019/12/13
Algebra reconstruction technique
Electron tomography
Filtered iterative reconstruction technique
Information restoration
Nonlinear diffusion filter
A local-optimization refinement algorithm in single particle analysis for macromolecular complex with multiple rigid modules
期刊论文
PROTEIN & CELL, 2016, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 46-62
作者:
Shan, Hong
;
Wang, Zihao
;
Zhang, Fa
;
Xiong, Yong
;
Yin, Chang-Cheng
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:58/0
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提交时间:2019/12/13
cryo-electron microscopy
single particle analysis
conformational heterogeneity
rigid module
local optimization refinement
A novel fully automatic scheme for fiducial marker-based alignment in electron tomography
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2015, 卷号: 192, 期号: 3, 页码: 403-417
作者:
Han, Renmin
;
Wang, Liansan
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2019/12/13
Electron tomography
Alignment
Point set registration
Four point invariant