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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Improved Denoising of Cryo-Electron Microscopy Micrographs with Simulation-Aware Pretraining
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2024, 页码: 12
作者:
Yang, Zhidong
;
Li, Hongjia
;
Zang, Dawei
;
Han, Renmin
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:1/0
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提交时间:2024/12/06
cryo-EM
image denoising
noise simulation and deep learning
MarkerDetector: A method for robust fiducial marker detection in electron micrographs using wavelet-based template
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2024, 卷号: 216, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Hou, Gaoxin
;
Yang, Zhidong
;
Zang, Dawei
;
Fernandez, Jose-Jesus
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
收藏
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浏览/下载:13/0
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提交时间:2024/05/20
Electron microscopy
Wavelet transform
Template matching
Fiducial marker detection
Self-supervised noise modeling and sparsity guided electron tomography volumetric image denoising
期刊论文
ULTRAMICROSCOPY, 2024, 卷号: 255, 页码: 11
作者:
Yang, Zhidong
;
Zang, Dawei
;
Li, Hongjia
;
Zhang, Zhao
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
收藏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
Electron tomography
Image denoising
Self-supervised learning
Determining protein structures in cellular lamella at pseudo-atomic resolution by GisSPA
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2023, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 9
作者:
Cheng, Jing
;
Liu, Tong
;
You, Xin
;
Zhang, Fa
;
Sui, Sen-Fang
;
Wan, Xiaohua
;
Zhang, Xinzheng
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浏览/下载:18/0
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提交时间:2023/12/04
Correction of image distortion in large-field ssEM stitching by an unsupervised intermediate-space solving network
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 20, 页码: 4797-4805
作者:
He, Bintao
;
Zhang, Yan
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
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浏览/下载:19/0
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提交时间:2023/07/12
Noise-Transfer2Clean: denoising cryo-EM images based on noise modeling and transfer
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 8
作者:
Li, Hongjia
;
Zhang, Hui
;
Wan, Xiaohua
;
Yang, Zhidong
;
Li, Chengmin
;
Li, Jintao
;
Han, Renmin
;
Zhu, Ping
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:28/0
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提交时间:2022/12/07
Macromolecules Structural Classification With a 3D Dilated Dense Network in Cryo-Electron Tomography
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 19, 期号: 1, 页码: 209-219
作者:
Gao, Shan
;
Han, Renmin
;
Zeng, Xiangrui
;
Liu, Zhiyong
;
Xu, Min
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:24/0
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提交时间:2022/12/07
Cryo-electron tomography
image classification
convolution neural network
DETECTOR: structural information guided artifact detection for super-resolution fluorescence microscopy image
期刊论文
BIOMEDICAL OPTICS EXPRESS, 2021, 卷号: 12, 期号: 9, 页码: 5751-5769
作者:
Gao, Shan
;
Xu, Fan
;
Li, Hongjia
;
Xue, Fudong
;
Zhang, Mingshu
;
Xu, Pingyong
;
Zhang, Fa
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浏览/下载:46/0
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提交时间:2021/12/01
Multi-labelled proteins recognition for high-throughput microscopy images using deep convolutional neural networks
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: SUPPL 3, 页码: 14
作者:
Zhang, Enze
;
Zhang, Boheng
;
Hu, Shaohan
;
Zhang, Fa
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
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浏览/下载:47/0
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提交时间:2021/12/01
Protein pattern recognition
DNNs
Multi-class and multi-label
Label imbalance
High-throughput microscopy images