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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Accurate and robust protein sequence design with CarbonDesign
期刊论文
NATURE MACHINE INTELLIGENCE, 2024, 卷号: 6, 期号: 5, 页码: 14
作者:
Ren, Milong
;
Yu, Chungong
;
Bu, Dongbo
;
Zhang, Haicang
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浏览/下载:7/0
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提交时间:2024/12/06
Accurate prediction of RNA secondary structure including pseudoknots through solving minimum-cost flow with learned potentials
期刊论文
COMMUNICATIONS BIOLOGY, 2024, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Gong, Tiansu
;
Ju, Fusong
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
NeuralGLS: learning to guide local search with graph convolutional network for the traveling salesman problem
期刊论文
NEURAL COMPUTING & APPLICATIONS, 2023, 页码: 20
作者:
Sui, Jingyan
;
Ding, Shizhe
;
Xia, Boyang
;
Liu, Ruizhi
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:17/0
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提交时间:2023/12/04
Graph convolutional network
Guided local search
Traveling salesman problem
Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigms
期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 21, 期号: 5, 页码: 913-925
作者:
Huang, Bin
;
Kong, Lupeng
;
Wang, Chao
;
Ju, Fusong
;
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Gong, Tiansu
;
Zhang, Haicang
;
Yu, Chungong
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:10/0
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提交时间:2024/05/20
Protein folding
Protein structure prediction
Deep learning
Transformer
Language model
Revolutionizing Antibody Discovery: An Innovative AI Model for Generating Robust Libraries
期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 21, 期号: 5, 页码: 910-912
作者:
Wang, Yaojun
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
GIPS-Mix for Accurate Identification of Isomeric Components in Glycan Mixtures Using Intelligent Group-Opting Strategy
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2022, 页码: 9
作者:
Huang, Chuncui
;
Hou, Meijie
;
Yan, Jingyu
;
Wang, Hui
;
Wang, Yu
;
Cao, Cuiyan
;
Wang, Yaojun
;
Gao, Huanyu
;
Ma, Xinyue
;
Zheng, Yi
;
Bu, Dongbo
;
Chai, Wengang
;
Li, Yan
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载:23/0
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提交时间:2023/07/12
Seq-SetNet: directly exploiting multiple sequence alignment for protein secondary structure prediction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 4, 页码: 990-996
作者:
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Zhang, Qi
;
Wei, Guozheng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:27/0
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提交时间:2022/12/07
The effect of N-glycosylation of SARS-CoV-2 spike protein on the virus interaction with the host cell ACE2 receptor
期刊论文
ISCIENCE, 2021, 卷号: 24, 期号: 11, 页码: 15
作者:
Huang, Chuncui
;
Tan, Zeshun
;
Zhao, Keli
;
Zou, Wenjun
;
Wang, Hui
;
Gao, Huanyu
;
Sun, Shiwei
;
Bu, Dongbo
;
Chai, Wengang
;
Li, Yan
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浏览/下载:31/0
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提交时间:2022/12/07
FALCON2: a web server for high-quality prediction of protein tertiary structures
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 14
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zhang, Haicang
;
Sun, Shiwei
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:46/0
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提交时间:2021/12/01
Protein structure prediction
Template-based modeling
Ab initio prediction
Protein structure prediction web service
HepParser: An Intelligent Software Program for Deciphering Low-Molecular-Weight Heparin Based on Mass Spectrometry
期刊论文
FRONTIERS IN CHEMISTRY, 2021, 卷号: 9, 页码: 13
作者:
Wang, Hui
;
Wang, Yu
;
Hou, Meijie
;
Zhang, Chunming
;
Wang, Yaojun
;
Guo, Zhendong
;
Bu, Dongbo
;
Li, Yan
;
Huang, Chuncui
;
Sun, Shiwei
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浏览/下载:45/0
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提交时间:2021/12/01
LMWHs
mass spectrometry
glycosaminoglycans
isotopic distribution
computational method