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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Sparse and Hierarchical Transformer for Survival Analysis on Whole Slide Images
期刊论文
IEEE JOURNAL OF BIOMEDICAL AND HEALTH INFORMATICS, 2024, 卷号: 28, 期号: 1, 页码: 7-18
作者:
Yan, Rui
;
Lv, Zhilong
;
Yang, Zhidong
;
Lin, Senlin
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:10/0
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提交时间:2024/05/20
Hierarchical representation
pathological image analysis
sparse transformer
survival analysis
TransSurv: Transformer-Based Survival Analysis Model Integrating Histopathological Images and Genomic Data for Colorectal Cancer
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 20, 期号: 6, 页码: 3411-3420
作者:
Lv, Zhilong
;
Lin, Yuexiao
;
Yan, Rui
;
Wang, Ying
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:42/0
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提交时间:2024/05/20
Cancer
Genomics
Bioinformatics
Transformers
Tumors
Feature extraction
Prognostics and health management
Survival analysis
multi-modal learning
transformer
histopathological slides
genomic data
Histopathological bladder cancer gene mutation prediction with hierarchical deep multiple-instance learning
期刊论文
MEDICAL IMAGE ANALYSIS, 2023, 卷号: 87, 页码: 13
作者:
Yan, Rui
;
Shen, Yijun
;
Zhang, Xueyuan
;
Xu, Peihang
;
Wang, Jun
;
Li, Jintao
;
Ren, Fei
;
Ye, Dingwei
;
Zhou, S. Kevin
收藏
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浏览/下载:24/0
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提交时间:2023/12/04
Bladder cancer
Contrastive learning
Gene mutation prediction
Histopathological image analysis
Multiple instance learning
基于多尺度注意力机制的真菌显微图像分类方法
期刊论文
协和医学杂志, 2023, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 139
作者:
张雪媛
;
许鸿雁
;
董跃明
;
刘丹凤
;
孙鹏蕊
;
颜锐
;
崔洪亮
;
雷红
;
任菲
收藏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
fungal
convolutional neural network
image classification
multi-scale attention mechanism
真菌
卷积神经网络
图像分类
多尺度注意力机制
Divide-and-Attention Network for HE-Stained Pathological Image Classification
期刊论文
BIOLOGY-BASEL, 2022, 卷号: 11, 期号: 7, 页码: 17
作者:
Yan, Rui
;
Yang, Zhidong
;
Li, Jintao
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
pathological image classification
attention mechanism
convolutional neural network
knowledge embedding
Nuclei-Guided Network for Breast Cancer Grading in HE-Stained Pathological Images
期刊论文
SENSORS, 2022, 卷号: 22, 期号: 11, 页码: 15
作者:
Yan, Rui
;
Ren, Fei
;
Li, Jintao
;
Rao, Xiaosong
;
Lv, Zhilong
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
breast cancer grading
histopathological image
nuclei segmentation
convolutional neural network
attention mechanism
VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms
期刊论文
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, 2022, 卷号: 221, 页码: 14
作者:
Hao, Yu
;
Wan, Xiaohua
;
Yan, Rui
;
Liu, Zhiyong
;
Li, Jintao
;
Zhang, Shihua
;
Cui, Xuefeng
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2023/07/12
Cryo-ET
Sub-tomogram averaging
Particle localization
Particle classification
Convolutional neural networks
Breast Cancer Molecular Subtype Prediction on Pathological Images with Discriminative Patch Selection and Multi-Instance Learning
期刊论文
FRONTIERS IN ONCOLOGY, 2022, 卷号: 12, 页码: 11
作者:
Liu, Hong
;
Xu, Wen-Dong
;
Shang, Zi-Hao
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Wang, Xiang-Dong
;
Zhou, Hai-Yan
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Ma, Ke-Wen
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Zhou, Huan
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Qi, Jia-Lin
;
Jiang, Jia-Rui
;
Tan, Li-Lan
;
Zeng, Hui-Min
;
Cai, Hui-Juan
;
Wang, Kuan-Song
;
Qian, Yue-Liang
收藏
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浏览/下载:36/0
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提交时间:2022/12/07
pathological image
weakly supervised learning
molecular subtype
breast cancer
H&E
Richer fusion network for breast cancer classification based on multimodal data
期刊论文
BMC Medical Informatics and Decision Making, 2021, 卷号: 21, 期号: Suppl 1
作者:
Yan,Rui
;
Zhang,Fa
;
Rao,Xiaosong
;
Lv,Zhilong
;
Li,Jintao
;
Zhang,Lingling
;
Liang,Shuang
;
Li,Yilin
;
Ren,Fei
;
Zheng,Chunhou
;
Liang,Jun
收藏
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浏览/下载:43/0
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提交时间:2021/12/01
Pathological image
Electronic medical record
Multimodal fusion
Breast cancer classification
Convolutional neural network
Perspective-Adaptive Convolutions for Scene Parsing
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE, 2020, 卷号: 42, 期号: 4, 页码: 909-924
作者:
Zhang, Rui
;
Tang, Sheng
;
Zhang, Yongdong
;
Li, Jintao
;
Yan, Shuicheng
收藏
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浏览/下载:51/0
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提交时间:2020/12/10
Shape
Standards
Strain
Proposals
Convolutional neural networks
Training
Task analysis
Scene parsing
convolutional neural networks
perspective-adaptive convolutions
context adaptive biases