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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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DHSA: efficient doubly homomorphic secure aggregation for cross-silo federated learning
期刊论文
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, 2022, 页码: 31
作者:
Liu, Zizhen
;
Chen, Si
;
Ye, Jing
;
Fan, Junfeng
;
Li, Huawei
;
Li, Xiaowei
收藏
  |  
浏览/下载:26/0
  |  
提交时间:2022/12/07
Federated learning
Security
Efficient
Homomorphic
Recent Progress in Chemical Cross-linking Coupled With Mass Spectrometry
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2022, 卷号: 49, 期号: 4, 页码: 737-758
作者:
Chen Zhen-Lin
;
Cao Yong
;
He Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:29/0
  |  
提交时间:2022/12/07
cross-linking mass spectrometry
protein structure
protein interaction
proteomics
mass spectrometry
pDeepXL: MS/MS Spectrum Prediction for Cross-Linked Peptide Pairs by Deep Learning
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2021, 卷号: 20, 期号: 5, 页码: 2570-2582
作者:
Chen, Zhen-Lin
;
Mao, Peng-Zhi
;
Zeng, Wen-Feng
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:48/0
  |  
提交时间:2021/12/01
cross-linking mass spectrometry
spectrum prediction
deep learning
transfer learning
online fine-tuning
Improving mass spectrometry analysis of protein structures with arginine-selective chemical cross-linkers
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 卷号: 10, 页码: 11
作者:
Jones, Alexander X.
;
Cao, Yong
;
Tangi, Yu-Liang
;
Wang, Jian-Hua
;
Ding, Yue-He
;
Tan, Hui
;
Chen, Zhen-Lin
;
Fang, Run-Qian
;
Yin, Jili
;
Chen, Rong-Chang
;
Zhu, Xing
;
She, Yang
;
Huang, Niu
;
Shao, Feng
;
Ye, Keqiong
;
Sun, Rui-Xiang
;
He, Si-Min
;
Lei, Xiaoguang
;
Dong, Meng-Qiu
收藏
  |  
浏览/下载:102/0
  |  
提交时间:2019/12/10
An extravascular fluid transport system based on structural framework of fibrous connective tissues in human body
期刊论文
CELL PROLIFERATION, 2019, 页码: 14
作者:
Li, Hongyi
;
Yang, Chongqing
;
Yin, Yajun
;
Wang, Fang
;
Chen, Min
;
Xu, Liang
;
Wang, Naili
;
Zhang, Di
;
Wang, Xiaoxia
;
Kong, Yiya
;
Li, Qing
;
Su, Si
;
Cao, Yupeng
;
Liu, Wentao
;
Ao, Zhuo
;
Dai, Luru
;
Ma, Chao
;
Shang, Lijun
;
Han, Dong
;
Ji, Fusui
;
Li, Hua
收藏
  |  
浏览/下载:85/0
  |  
提交时间:2019/12/10
extracellular matrix
fibrous connective tissues
gross anatomy
interfacial transport
interstitial fluid
A high-speed search engine pLink 2 with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 卷号: 10, 页码: 12
作者:
Chen, Zhen-Lin
;
Meng, Jia-Ming
;
Cao, Yong
;
Yin, Ji-Li
;
Fang, Run-Qian
;
Fan, Sheng-Bo
;
Liu, Chao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Ding, Yue-He
;
Tan, Dan
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Dong, Meng-Qiu
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:102/0
  |  
提交时间:2019/12/10
Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine
期刊论文
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2018, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 1059-+
作者:
Chi, Hao
;
Liu, Chao
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Wang, Rui-Min
;
Niu, Xiu-Nan
;
Ding, Yue-He
;
Zhang, Yao
;
Wang, Zhao-Wei
;
Chen, Zhen-Lin
;
Sun, Rui-Xiang
;
Liu, Tao
;
Tan, Guang-Ming
;
Dong, Meng-Qiu
;
Xu, Ping
;
Zhang, Pei-Heng
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:95/0
  |  
提交时间:2019/08/16
SMG-1 inhibition by miR-192/-215 causes epithelial-mesenchymal transition in gastric carcinogenesis via activation of Wnt signaling
期刊论文
CANCER MEDICINE, 2018, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 146-156
作者:
Zhang, Xiaojing
;
Peng, Yin
;
Huang, Yong
;
Yang, Mengting
;
Yan, Ruibin
;
Zhao, Yanqiu
;
Cheng, Yulan
;
Liu, Xi
;
Deng, Shiqi
;
Feng, Xianling
;
Lin, Huijuan
;
Yu, Huimin
;
Chen, Si
;
Zhao, Zhenfu
;
Li, Shanni
;
Li, Kuan
;
Wang, Liang
;
Wei, Yanjie
;
He, Zhendan
;
Fan, Xinmin
;
Meltzer, Stephen J.
;
Li, Song
;
Jin, Zhe
收藏
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浏览/下载:74/0
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提交时间:2019/12/10
EMT
gastric cancer
miR-192/-215
SMG-1
Wnt signaling pathway
pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2018, 卷号: 17, 期号: 1, 页码: 119-128
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
Liu, Chao
;
Wang, Rui-Min
;
Wang, Zhao-Wei
;
Niu, Xiu-Nan
;
Chen, Zhen-Lin
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:82/0
  |  
提交时间:2019/12/10
tandem mass spectrometry
de novo peptide sequencing
modification site localization
phosphorylation
pFind-Alioth: A novel unrestricted database search algorithm to improve the interpretation of high-resolution MS/MS data (Reprinted from vol 125, pg 89-97, 2015)
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOMICS, 2015, 卷号: 129, 页码: 33-41
作者:
Chi, Hao
;
He, Kun
;
Yang, Bing
;
Chen, Zhen
;
Sun, Rui-Xiang
;
Fan, Sheng-Bo
;
Zhang, Kun
;
Liu, Chao
;
Yuan, Zuo-Fei
;
Wang, Quan-Hui
;
Liu, Si-Qi
;
Dong, Meng-Qiu
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:60/0
  |  
提交时间:2019/12/13
Unrestricted database search
Ion index
In-depth interpretation
High resolution MS/MS