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A reconfigurable accelerator for Smith-Waterman algorithm 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON CIRCUITS AND SYSTEMS II-EXPRESS BRIEFS, 2007, 卷号: 54, 期号: 12, 页码: 1077-1081
作者:  Jiang, Xianyang;  Liu, Xinchun;  Xu, Lin;  Zhang, Peiheng;  Sun, Ninghui
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bioinformatics  computational complexity  field-programmable gate array (FPGA)  reconfigurable accelerator  Smith-Waterman (SW) algorithm  
Improvement of performance of MegaBlast algorithm for DNA sequence alignment 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2006, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 973-978
作者:  Tan, Guang-Ming;  Xu, Lin;  Bu, Dong-Bo;  Feng, Sheng-Zhong;  Sun, Ning-Hui
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sequence alignment  BLAST  MegaBlast  I/O intensive  parallelization  
无权访问的条目 期刊论文
作者:  徐琳;  李晓民;  谭光明;  刘新春;  卜东波;  冯圣中;  孙凝晖
Adobe PDF(245Kb)  |  收藏  |  浏览/下载:0/0  |  提交时间:2010/10/22
无权访问的条目 期刊论文
作者:  Guang-Ming Tan(谭光明);  Lin Xu(徐琳);  Dong-Bo Bu(卜东波);  Sheng-Zhong Feng(冯圣中);  Ning-Hui Sun(孙凝晖)
Adobe PDF(360Kb)  |  收藏  |  浏览/下载:0/0  |  提交时间:2010/11/04
基于曙光4000A的BLAST并行算法 期刊论文
计算机工程, 2006, 卷号: 32.0, 期号: 010, 页码: 45
作者:  谭光明;  徐琳;  周幼英;  冯圣中
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BLAST  批处理  并行  集群  曙光4000A  
基于SSE2的Smith-Waterman算法 期刊论文
计算机工程与应用, 2006, 卷号: 42.0, 期号: 011, 页码: 85
作者:  戴正华;  张庆丹;  徐琳;  谭光明;  冯圣中
收藏  |  浏览/下载:12/0  |  提交时间:2023/12/04
Smith-Waterman  算法  细粒度并行算法  SIMD  SSE2  
面向FPGA的RNA二级结构预测并行算法研究 期刊论文
计算机学报, 2006, 卷号: 29.0, 期号: 002, 页码: 233
作者:  徐琳;  李晓民;  谭光明;  刘新春;  卜东波;  冯圣中
收藏  |  浏览/下载:10/0  |  提交时间:2023/12/04
RNA  二级结构预测  FPGA  并行  流水  
曙光4000H生物信息处理专用计算机的高性能算法研究 期刊论文
计算机研究与发展, 2005, 卷号: 42.0, 期号: 006, 页码: 1053
作者:  冯圣中;  谭光明;  徐琳;  孙凝晖;  徐志伟
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可重构计算  生物信息学  高性能计算  
真实感人脸建模研究的进展与展望 期刊论文
软件学报, 2003, 卷号: 14.0, 期号: 004, 页码: 804
作者:  徐琳;  袁保宗;  高文
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真实感人脸  建模  计算机图形学  面部合成  人机交互