中国科学院计算技术研究所机构知识库

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	Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics* 期刊论文 PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125 作者:  Zhou Wen-Jing;  Zeng Wen-Feng;  Chi Hao;  He Si-Min 收藏  |  浏览/下载：13/0  |  提交时间：2023/12/04 proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods
	Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics br 期刊论文 PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125 作者:  Zhou, Wen-Jing;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：35/0  |  提交时间：2023/12/04 proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods
	pValid 2: A deep learning based validation method for peptide identification in shotgun proteomics with increased discriminating power 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOMICS, 2022, 卷号: 251, 页码: 9 作者:  Zhou, Wen-Jing;  Wei, Zhuo-Hong;  He, Si-Min;  Chi, Hao 收藏  |  浏览/下载：39/0  |  提交时间：2022/06/21 Proteomics  Tandem mass spectrometry  Retention time  Validation method  Deep learning
	Prediction and analysis of multiple protein lysine modified sites based on conditional wasserstein generative adversarial networks 期刊论文 BMC BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 17 作者:  Yang, Yingxi;  Wang, Hui;  Li, Wen;  Wang, Xiaobo;  Wei, Shizhao;  Liu, Yulong;  Xu, Yan 收藏  |  浏览/下载：43/0  |  提交时间：2021/12/01 Post-translational modification  Deep learning  Generative adversarial networks  Random forest
	Deep Learning in Proteomics 期刊论文 PROTEOMICS, 2020, 页码: 21 作者:  Wen, Bo;  Zeng, Wen-Feng;  Liao, Yuxing;  Shi, Zhiao;  Savage, Sara R.;  Jiang, Wen;  Zhang, Bing 收藏  |  浏览/下载：35/0  |  提交时间：2021/12/01 bioinformatics  deep learning  proteomics
	pNovo 3: precise de novo peptide sequencing using a learning-to-rank framework 期刊论文 BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 14, 页码: I183-I190 作者:  Yang, Hao;  Chi, Hao;  Zeng, Wen-Feng;  Zhou, Wen-Jing;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：78/0  |  提交时间：2019/12/10
	TagDict: Prediction of Theoretical Spectra of Peptides Based on A Tag Dictionary 期刊论文 CURRENT BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 13, 期号: 5, 页码: 444-449 作者:  Wang, Yaojun;  Zhang, Jingwei;  Bu, Dongbo;  Sun, Shiwei 收藏  |  浏览/下载：71/0  |  提交时间：2019/12/10 Mass spectrometry  theoretical spectrum prediction  database search  peptide identification  TagDict  MassAnalyzer
	pFind-Alioth: A novel unrestricted database search algorithm to improve the interpretation of high-resolution MS/MS data (Reprinted from vol 125, pg 89-97, 2015) 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOMICS, 2015, 卷号: 129, 页码: 33-41 作者:  Chi, Hao;  He, Kun;  Yang, Bing;  Chen, Zhen;  Sun, Rui-Xiang;  Fan, Sheng-Bo;  Zhang, Kun;  Liu, Chao;  Yuan, Zuo-Fei;  Wang, Quan-Hui;  Liu, Si-Qi;  Dong, Meng-Qiu;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：59/0  |  提交时间：2019/12/13 Unrestricted database search  Ion index  In-depth interpretation  High resolution MS/MS
	Accelerating the scoring module of mass spectrometry-based peptide identification using GPUs 期刊论文 BMC Bioinformatics, 2014, 卷号: 15, 期号: 1 作者:  Li,You;  Chi,Hao;  Xia,Leihao;  Chu,Xiaowen 收藏  |  浏览/下载：49/0  |  提交时间：2019/08/16
	Open MS/MS spectral library search to identify unanticipated post-translational modifications and increase spectral identification rate 期刊论文 BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 26, 期号: 12, 页码: i399-i406 作者:  Ye, Ding;  Fu, Yan;  Sun, Rui-Xiang;  Wang, Hai-Peng;  Yuan, Zuo-Fei;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：58/0  |  提交时间：2019/12/16