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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics*
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:
Zhou Wen-Jing
;
Zeng Wen-Feng
;
Chi Hao
;
He Si-Min
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浏览/下载:10/0
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提交时间:2023/12/04
proteomics
mass spectrometry
target-decoy approach
false discovery rate
validation methods
Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics br
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:26/0
  |  
提交时间:2023/12/04
proteomics
mass spectrometry
target-decoy approach
false discovery rate
validation methods
Microbiome Resilience and Health Implications for People in Half-Year Travel
期刊论文
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2022, 卷号: 13, 页码: 15
作者:
Cheng, Mingyue
;
Liu, Hong
;
Han, Maozhen
;
Li, Shuai Cheng
;
Bu, Dongbo
;
Sun, Shiwei
;
Hu, Zhiqiang
;
Yang, Pengshuo
;
Wang, Rui
;
Liu, Yawen
;
Chen, Feng
;
Peng, Jianjun
;
Peng, Hong
;
Song, Hongxing
;
Xia, Yang
;
Chu, Liqun
;
Zhou, Quan
;
Guan, Feng
;
Wu, Jing
;
Tan, Guangming
;
Ning, Kang
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浏览/下载:25/0
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提交时间:2022/12/07
travel
enterotype
microbiome
bi-directional plasticity
resilience
dietary shift
immunity
health
pValid 2: A deep learning based validation method for peptide identification in shotgun proteomics with increased discriminating power
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOMICS, 2022, 卷号: 251, 页码: 9
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Wei, Zhuo-Hong
;
He, Si-Min
;
Chi, Hao
收藏
  |  
浏览/下载:33/0
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提交时间:2022/06/21
Proteomics
Tandem mass spectrometry
Retention time
Validation method
Deep learning
Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2021
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D18-D28
作者:
Xue, Yongbiao
;
Bao, Yiming
;
Zhang, Zhang
;
Zhao, Wenming
;
Xiao, Jingfa
;
He, Shunmin
;
Zhang, Guoqing
;
Li, Yixue
;
Zhao, Guoping
;
Chen, Runsheng
;
Song, Shuhui
;
Ma, Lina
;
Zou, Dong
;
Tian, Dongmei
;
Li, Cuiping
;
Zhu, Junwei
;
Gong, Zheng
;
Chen, Meili
;
Wang, Anke
;
Ma, Yingke
;
Li, Mengwei
;
Teng, Xufei
;
Cui, Ying
;
Duan, Guangya
;
Zhang, Mochen
;
Jin, Tong
;
Shi, Chengmin
;
Du, Zhenglin
;
Zhang, Yadong
;
Liu, Chuandong
;
Li, Rujiao
;
Zeng, Jingyao
;
Hao, Lili
;
Jiang, Shuai
;
Chen, Hua
;
Han, Dali
;
Yongbiao, Xue
;
Zhang, Tao
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Kang, Wang
;
Qu, Jing
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Zhang, Weiqi
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Liu, Guang-Hui
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Zhang, Yang
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Zhao, Fangqing
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Peng, Di
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Luo, Hao
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Ning, Wanshan
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Lin, Shaofeng
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Liu, Teng
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Guo, An-Yuan
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Yuan, Hao
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Zhang, Yong E.
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Zhang, Weizhi
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Xie, Yubin
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Wang, Chenwei
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Liu, Chun-Jie
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Yang, De-Chang
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Tian, Feng
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Gao, Ge
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Tang, Dachao
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Yao, Lan
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Cui, Qinghua
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An, Ni A.
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Li, Chuan-Yun
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Luo, XiaoTong
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提交时间:2021/12/01
A mobile services recommendation system fuses implicit and explicit user trust relationships
期刊论文
JOURNAL OF AMBIENT INTELLIGENCE AND SMART ENVIRONMENTS, 2021, 卷号: 13, 期号: 1, 页码: 21-35
作者:
Luo, Pengcheng
;
Zhang, Jilin
;
Wan, Jian
;
Zhao, Nailiang
;
Ren, Zujie
;
Zhou, Li
;
Shen, Jing
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提交时间:2021/12/01
Collaborative filtering
data management
data mining
matrix factorization
recommendation system
social network
Resilience of human gut microbial communities for the long stay with multiple dietary shifts
期刊论文
GUT, 2019, 卷号: 68, 期号: 12, 页码: 2254-+
作者:
Liu, Hong
;
Han, Maozhen
;
Li, Shuai Cheng
;
Tan, Guangming
;
Sun, Shiwei
;
Hu, Zhiqiang
;
Yang, Pengshuo
;
Wang, Rui
;
Liu, Yawen
;
Chen, Feng
;
Peng, Jianjun
;
Peng, Hong
;
Song, Hongxing
;
Xia, Yang
;
Chu, Liqun
;
Zhou, Quan
;
Guan, Feng
;
Wu, Jing
;
Bu, Dongbo
;
Ning, Kang
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提交时间:2020/12/10
MS/MS Spectrum Prediction for Modified Peptides Using pDeep2 Trained by Transfer Learning
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2019, 卷号: 91, 期号: 15, 页码: 9724-9731
作者:
Zeng, Wen-Feng
;
Zhou, Xie-Xuan
;
Zhou, Wen-Jing
;
Chi, Hao
;
Zhan, Jianfeng
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/10
NF-kappa B-driven miR-34a impairs Treg/Th17 balance via targeting Foxp3
期刊论文
JOURNAL OF AUTOIMMUNITY, 2019, 卷号: 102, 页码: 96-113
作者:
Xie, Mengxiao
;
Wang, Jingzhe
;
Gong, Wen
;
Xu, Huiling
;
Pan, Xiaoyuan
;
Chen, Yunpeng
;
Ru, Songwei
;
Wang, Hui
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Chen, Xiaodan
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Zhao, Yi
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Li, Jing
;
Yin, Qing
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Xia, Sheng
;
Zhou, Xiaoming
;
Liu, Xia
;
Shao, Qixiang
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提交时间:2019/12/10
A high-speed search engine pLink 2 with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 卷号: 10, 页码: 12
作者:
Chen, Zhen-Lin
;
Meng, Jia-Ming
;
Cao, Yong
;
Yin, Ji-Li
;
Fang, Run-Qian
;
Fan, Sheng-Bo
;
Liu, Chao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Ding, Yue-He
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Tan, Dan
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Wu, Long
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Zhou, Wen-Jing
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Chi, Hao
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Sun, Rui-Xiang
;
Dong, Meng-Qiu
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He, Si-Min
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提交时间:2019/12/10