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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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PPRTGI: A Personalized PageRank Graph Neural Network for TF-Target Gene Interaction Detection
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2024, 卷号: 21, 期号: 3, 页码: 480-491
作者:
Ma, Ke
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Li, Jiawei
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Zhao, Mengyuan
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Zamit, Ibrahim
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Lin, Bin
;
Guo, Fei
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Tang, Jijun
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提交时间:2024/12/06
DNA
Proteins
Organisms
Biology
Proteomics
Gene expression
Feature extraction
Transcription factor
TF-target gene interactions
DNA sequence
graph neural network
personalized PageRank
Insights into the role of long non-coding RNAs in DNA methylation mediated transcriptional regulation
期刊论文
FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, 2022, 卷号: 9, 页码: 23
作者:
Yang, Zhen
;
Xu, Feng
;
Teschendorff, Andrew E.
;
Zhao, Yi
;
Yao, Lei
;
Li, Jian
;
He, Yungang
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提交时间:2023/07/12
lncRNA
circRNA
DNA methylation
histone modification
transcriptional regulation
regulatory network
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学位论文
作者:
郑华杰
Adobe PDF(3545Kb)
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提交时间:2015/06/29
Molecular logic computing model based on self-assembly of DNA nanoparticles
期刊论文
CHINESE SCIENCE BULLETIN, 2011, 卷号: 56, 期号: 33, 页码: 3566-3571
作者:
Zhang Cheng
;
Yang Jing
;
Xu Jin
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提交时间:2019/12/16
logic computing
DNA computing
nanoparticle
DNA self-assembly
GC content variability of eubacteria is governed by the pol III alpha subunit
期刊论文
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2007, 卷号: 356, 期号: 1, 页码: 20-25
作者:
Zhao, Xiaoqian
;
Zhang, Zhang
;
Yan, Jiangwei
;
Yu, Jun
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提交时间:2019/12/16
genomic GC content
DNA polymerase III alpha subunit
dnaE
polC
Genome-wide analysis of mammalian DNA segment fusion/fission
期刊论文
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, 2006, 卷号: 240, 期号: 2, 页码: 200-208
作者:
Zhang, Zhihua
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Sun, Hong
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Zhang, Yong
;
Zhao, Yi
;
Shi, Baochen
;
Sun, Shiwei
;
Lu, Hongchao
;
Bu, Dongbo
;
Ling, Lunjiang
;
Chen, Runsheng
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提交时间:2019/12/16
fusion
fission
mammalian comparative genomic
non-protein coding DNA segment