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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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中国科学院计算技术研... [7]
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Chi, Hao [7]
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期刊论文 [7]
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2019 [3]
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pNovo 3: precise de novo peptide sequencing using a learning-to-rank framework
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 14, 页码: I183-I190
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Zhou, Wen-Jing
;
He, Si-Min
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浏览/下载:80/0
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提交时间:2019/12/10
pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2019, 卷号: 18, 期号: 7, 页码: 2747-2758
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Zhang, Kun
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:256/0
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提交时间:2019/08/16
tandem mass spectrometry
target-decoy approach
validation methods
false-positive rate
false-negative rate
Precision De Novo Peptide Sequencing Using Mirror Proteases of Ac-LysargiNase and Trypsin for Large-scale Proteomics
期刊论文
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, 2019, 卷号: 18, 期号: 4, 页码: 773-785
作者:
Yang, Hao
;
Li, Yan-Chang
;
Zhao, Ming-Zhi
;
Wu, Fei-Lin
;
Wang, Xi
;
Xiao, Wei-Di
;
Wang, Yi-Hao
;
Zhang, Jun-Ling
;
Wang, Fu-Qiang
;
Xu, Feng
;
Zengt, Wen-Feng
;
Overall, Christopher M.
;
He, Si-Min
;
Chi, Hao
;
Xu, Ping
收藏
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浏览/下载:286/0
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提交时间:2019/08/16
Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine
期刊论文
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2018, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 1059-+
作者:
Chi, Hao
;
Liu, Chao
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Wang, Rui-Min
;
Niu, Xiu-Nan
;
Ding, Yue-He
;
Zhang, Yao
;
Wang, Zhao-Wei
;
Chen, Zhen-Lin
;
Sun, Rui-Xiang
;
Liu, Tao
;
Tan, Guang-Ming
;
Dong, Meng-Qiu
;
Xu, Ping
;
Zhang, Pei-Heng
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:95/0
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提交时间:2019/08/16
pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2018, 卷号: 17, 期号: 1, 页码: 119-128
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
Liu, Chao
;
Wang, Rui-Min
;
Wang, Zhao-Wei
;
Niu, Xiu-Nan
;
Chen, Zhen-Lin
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:82/0
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提交时间:2019/12/10
tandem mass spectrometry
de novo peptide sequencing
modification site localization
phosphorylation
pGlyco 2.0 enables precision N-glycoproteomics with comprehensive quality control and one-step mass spectrometry for intact glycopeptide identification
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2017, 卷号: 8, 页码: 14
作者:
Liu, Ming-Qi
;
Zeng, Wen-Feng
;
Fang, Pan
;
Cao, Wei-Qian
;
Liu, Chao
;
Yan, Guo-Quan
;
Zhang, Yang
;
Peng, Chao
;
Wu, Jian-Qiang
;
Zhang, Xiao-Jin
;
Tu, Hui-Jun
;
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Cao, Yong
;
Dong, Meng-Qiu
;
Jiang, Bi-Yun
;
Huang, Jiang-Ming
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Shen, Hua-Li
;
Wong, Catherine C. L.
;
He, Si-Min
;
Yang, Peng-Yuan
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提交时间:2019/12/12
Open-pNovo: De Novo Peptide Sequencing with Thousands of Protein Modifications
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2017, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 645-654
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
He, Kun
;
Liu, Chao
;
Sun, Rui-Xiang
;
He, Si-Min
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浏览/下载:58/0
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提交时间:2019/12/12
tandem mass spectrometry
de novo peptide sequencing
dynamic programming
unexpected modifications