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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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DeepFusion: A deep bimodal information fusion network for unraveling protein-RNA interactions using in vivo RNA structures
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 卷号: 23, 页码: 617-625
作者:
Qiao, Yixuan
;
Yang, Rui
;
Liu, Yang
;
Chen, Jiaxin
;
Zhao, Lianhe
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:16/0
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提交时间:2024/05/20
Information fusion
Deep learning
RNA -binding proteins
In vivo RNA structures
Motifs
Histopathological bladder cancer gene mutation prediction with hierarchical deep multiple-instance learning
期刊论文
MEDICAL IMAGE ANALYSIS, 2023, 卷号: 87, 页码: 13
作者:
Yan, Rui
;
Shen, Yijun
;
Zhang, Xueyuan
;
Xu, Peihang
;
Wang, Jun
;
Li, Jintao
;
Ren, Fei
;
Ye, Dingwei
;
Zhou, S. Kevin
收藏
  |  
浏览/下载:24/0
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提交时间:2023/12/04
Bladder cancer
Contrastive learning
Gene mutation prediction
Histopathological image analysis
Multiple instance learning
Biological knowledge graph-guided investigation of immune therapy response in cancer with graph neural network
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 24, 期号: 2, 页码: 9
作者:
Zhao, Lianhe
;
Qi, Xiaoning
;
Chen, Yang
;
Qiao, Yixuan
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Luo, Yufan
;
Wang, Sheng
;
Zhang, Rui
;
Zhao, Yi
收藏
  |  
浏览/下载:18/0
  |  
提交时间:2023/12/04
immune checkpoints inhibitors
deep learning
graph neural networks
Immunohistochemical HER2 Recognition and Analysis of Breast Cancer Based on Deep Learning
期刊论文
DIAGNOSTICS, 2023, 卷号: 13, 期号: 2, 页码: 14
作者:
Che, Yuxuan
;
Ren, Fei
;
Zhang, Xueyuan
;
Cui, Li
;
Wu, Huanwen
;
Zhao, Ze
收藏
  |  
浏览/下载:21/0
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提交时间:2023/07/12
breast cancer
HER2
IHC
whole-slide image
deep learning
Divide-and-Attention Network for HE-Stained Pathological Image Classification
期刊论文
BIOLOGY-BASEL, 2022, 卷号: 11, 期号: 7, 页码: 17
作者:
Yan, Rui
;
Yang, Zhidong
;
Li, Jintao
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
pathological image classification
attention mechanism
convolutional neural network
knowledge embedding
Cross Analysis of Genomic-Pathologic Features on Multiple Primary Hepatocellular Carcinoma
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2022, 卷号: 13, 页码: 9
作者:
Ren, Fei
;
Wang, Depin
;
Zhang, Xueyuan
;
Zhao, Na
;
Wang, Xiaowen
;
Zhang, Yu
;
Li, Li
收藏
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浏览/下载:21/0
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提交时间:2023/07/12
hepatocellular carcinoma
whole exome sequencing
whole slide images
molecular profiling and subtyping
hepatitis B virus
Nuclei-Guided Network for Breast Cancer Grading in HE-Stained Pathological Images
期刊论文
SENSORS, 2022, 卷号: 22, 期号: 11, 页码: 15
作者:
Yan, Rui
;
Ren, Fei
;
Li, Jintao
;
Rao, Xiaosong
;
Lv, Zhilong
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
breast cancer grading
histopathological image
nuclei segmentation
convolutional neural network
attention mechanism
VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms
期刊论文
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, 2022, 卷号: 221, 页码: 14
作者:
Hao, Yu
;
Wan, Xiaohua
;
Yan, Rui
;
Liu, Zhiyong
;
Li, Jintao
;
Zhang, Shihua
;
Cui, Xuefeng
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2023/07/12
Cryo-ET
Sub-tomogram averaging
Particle localization
Particle classification
Convolutional neural networks