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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Multi-labelled proteins recognition for high-throughput microscopy images using deep convolutional neural networks
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: SUPPL 3, 页码: 14
作者:
Zhang, Enze
;
Zhang, Boheng
;
Hu, Shaohan
;
Zhang, Fa
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
收藏
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浏览/下载:47/0
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提交时间:2021/12/01
Protein pattern recognition
DNNs
Multi-class and multi-label
Label imbalance
High-throughput microscopy images
Compressed sensing improved iterative reconstruction-reprojection algorithm for electron tomography
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 页码: 19
作者:
Li, Lun
;
Han, Renmin
;
Zhang, Zhaotian
;
Guo, Tiande
;
Liu, Zhiyong
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:35/0
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提交时间:2021/12/01
Electron tomography
Compressed sensing
Matching pursuit
Iterative reconstruction-reprojection
Live-SIMBA: an ImageJ plug-in for the universal and accelerated single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy (SIMBA) method
期刊论文
BIOMEDICAL OPTICS EXPRESS, 2020, 卷号: 11, 期号: 10, 页码: 5842-5859
作者:
Li, Hongjia
;
Xu, Fan
;
Gao, Shan
;
Zhang, Mingshu
;
Xue, Fudong
;
Xu, Pingyong
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:61/0
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提交时间:2020/12/10
A Parallel Cerebrovascular Segmentation Algorithm Based on Focused Multi-Gaussians Model and Heterogeneous Markov Random Field
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 2020, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 538-546
作者:
Lv, Zhilong
;
Mi, Fubo
;
Wu, Zhongke
;
Zhu, Yicheng
;
Liu, Xinyu
;
Tian, Mei
;
Zhang, Fa
;
Wang, Xingce
;
Wan, Xiaohua
收藏
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浏览/下载:64/0
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提交时间:2020/12/10
Gaussian distribution
Image segmentation
Particle swarm optimization
Optimization
Histograms
Markov random fields
Robustness
Three-dimensional cerebrovascular segmentation
focused multi-Gaussians model
Chaotic oscillation particle swarm optimization
Markov random field
Breast cancer histopathological image classification using a hybrid deep neural network
期刊论文
METHODS, 2020, 卷号: 173, 页码: 52-60
作者:
Yan, Rui
;
Ren, Fei
;
Wang, Zihao
;
Wang, Lihua
;
Zhang, Tong
;
Liu, Yudong
;
Rao, Xiaosong
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:55/0
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提交时间:2020/12/10
Breast cancer
Histopathological images
Image classification
Deep neural network
Dataset
A Consensus Framework of Distributed Multiple-Tilt Reconstruction in Electron Tomography
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 页码: 11
作者:
Wang, Zihao
;
Zhang, Jingrong
;
Gao, Weifang
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:51/0
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提交时间:2020/12/10
consensus optimization
cryoelectron tomography
multiple-tilt reconstruction
parallel computing
TxBR
AuTom-dualx: a toolkit for fully automatic fiducial marker-based alignment of dual-axis tilt series with simultaneous reconstruction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 2, 页码: 319-328
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Li, Lun
;
Lawrence, Albert
;
Yang, Peng
;
Li, Yu
;
Wang, Sheng
;
Sun, Fei
;
Liu, Zhiyong
;
Gao, Xin
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:81/0
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提交时间:2019/04/03
AutoGDeterm: Automatic Geometry Determination for Electron Tomography
期刊论文
TSINGHUA SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2018, 卷号: 23, 期号: 4, 页码: 369-376
作者:
Chen, Yu
;
Wang, Zihao
;
Li, Lun
;
Zhang, Jingrong
;
Wan, Xiaohua
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:79/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
geometry determination
human intervention
full automation
AutoGDeterm
comparable accuracy
AuTom: A novel automatic platform for electron tomography reconstruction
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 199, 期号: 3, 页码: 196-208
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Wang, Zihao
;
Hao, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Chen, Yu
;
Gao, Xin
;
Liu, Zhiyong
;
Ren, Fei
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography
Alignment
Reconstruction
Image processing workflow
Live cell single molecule-guided Bayesian localization super resolution microscopy
期刊论文
CELL RESEARCH, 2017, 卷号: 27, 期号: 5, 页码: 713-716
作者:
Xu, Fan
;
Zhang, Mingshu
;
He, Wenting
;
Han, Renmin
;
Xue, Fudong
;
Liu, Zhiyong
;
Zhang, Fa
;
Lippincott-Schwartz, Jennifer
;
Xu, Pingyong
收藏
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浏览/下载:65/0
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提交时间:2019/12/12