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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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DeepFusion: A deep bimodal information fusion network for unraveling protein-RNA interactions using in vivo RNA structures
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 卷号: 23, 页码: 617-625
作者:
Qiao, Yixuan
;
Yang, Rui
;
Liu, Yang
;
Chen, Jiaxin
;
Zhao, Lianhe
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Zhao, Yi
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提交时间:2024/05/20
Information fusion
Deep learning
RNA -binding proteins
In vivo RNA structures
Motifs
Predicting transcriptional responses to novel chemical perturbations using deep generative model for drug discovery
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2024, 卷号: 15, 期号: 1, 页码: 19
作者:
Qi, Xiaoning
;
Zhao, Lianhe
;
Tian, Chenyu
;
Li, Yueyue
;
Chen, Zhen-Lin
;
Huo, Peipei
;
Chen, Runsheng
;
Liu, Xiaodong
;
Wan, Baoping
;
Yang, Shengyong
;
Zhao, Yi
收藏
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提交时间:2024/12/06
Biological knowledge graph-guided investigation of immune therapy response in cancer with graph neural network
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 24, 期号: 2, 页码: 9
作者:
Zhao, Lianhe
;
Qi, Xiaoning
;
Chen, Yang
;
Qiao, Yixuan
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Luo, Yufan
;
Wang, Sheng
;
Zhang, Rui
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:18/0
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提交时间:2023/12/04
immune checkpoints inhibitors
deep learning
graph neural networks
KOBAS-i: intelligent prioritization and exploratory visualization of biological functions for gene enrichment analysis
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: W1, 页码: W317-W325
作者:
Bu, Dechao
;
Luo, Haitao
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Zhang, Shan
;
He, Zihao
;
Wu, Yang
;
Zhao, Lianhe
;
Liu, Jingjia
;
Guo, Jincheng
;
Fang, Shuangsang
;
Cao, Wanchen
;
Yi, Lan
;
Zhao, Yi
;
Kong, Lei
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浏览/下载:101/0
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提交时间:2021/12/01
NONCODEV6: an updated database dedicated to long non-coding RNA annotation in both animals and plants
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D165-D171
作者:
Zhao, Lianhe
;
Wang, Jiajia
;
Li, Yanyan
;
Song, Tingrui
;
Wu, Yang
;
Fang, Shuangsang
;
Bu, Dechao
;
Li, Hui
;
Sun, Liang
;
Pei, Dong
;
Zheng, Yu
;
Huang, Jianqin
;
Xu, Mingqing
;
Chen, Runsheng
;
Zhao, Yi
;
He, Shunmin
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浏览/下载:47/0
  |  
提交时间:2021/12/01
HERB: a high-throughput experiment- and reference-guided database of traditional Chinese medicine
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D1197-D1206
作者:
Fang, ShuangSang
;
Dong, Lei
;
Liu, Liu
;
Guo, JinCheng
;
Zhao, LianHe
;
Zhang, JiaYuan
;
Bu, DeChao
;
Liu, XinKui
;
Huo, PeiPei
;
Cao, WanChen
;
Dong, QiongYe
;
Wu, JiaRui
;
Zeng, Xiaoxi
;
Wu, Yang
;
Zhao, Yi
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提交时间:2021/12/01
FangNet: Mining herb hidden knowledge from TCM clinical effective formulas using structure network algorithm
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2021, 卷号: 19, 页码: 62-71
作者:
Bu, Dechao
;
Xia, Yan
;
Zhang, JiaYuan
;
Cao, Wanchen
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
He, Zihao
;
Ding, Linyi
;
Wu, Yang
;
Zhang, Shan
;
Gao, Kai
;
Yu, He
;
Liu, Tiegang
;
Ding, Xia
;
Gu, Xiaohong
;
Zhao, Yi
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提交时间:2021/12/01
Formulas
Herb
Symptom
TCM
DeepOmix: A scalable and interpretable multi-omics deep learning framework and application in cancer survival analysis
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2021, 卷号: 19, 页码: 2719-2725
作者:
Zhao, Lianhe
;
Dong, Qiongye
;
Luo, Chunlong
;
Wu, Yang
;
Bu, Dechao
;
Qi, Xiaoning
;
Luo, Yufan
;
Zhao, Yi
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提交时间:2021/12/01
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