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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Improved Denoising of Cryo-Electron Microscopy Micrographs with Simulation-Aware Pretraining
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2024, 页码: 12
作者:
Yang, Zhidong
;
Li, Hongjia
;
Zang, Dawei
;
Han, Renmin
;
Zhang, Fa
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浏览/下载:1/0
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提交时间:2024/12/06
cryo-EM
image denoising
noise simulation and deep learning
Self-supervised noise modeling and sparsity guided electron tomography volumetric image denoising
期刊论文
ULTRAMICROSCOPY, 2024, 卷号: 255, 页码: 11
作者:
Yang, Zhidong
;
Zang, Dawei
;
Li, Hongjia
;
Zhang, Zhao
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
收藏
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/20
Electron tomography
Image denoising
Self-supervised learning
HycDemux: a hybrid unsupervised approach for accurate barcoded sample demultiplexing in nanopore sequencing
期刊论文
GENOME BIOLOGY, 2023, 卷号: 24, 期号: 1, 页码: 29
作者:
Han, Renmin
;
Qi, Junhai
;
Xue, Yang
;
Sun, Xiujuan
;
Zhang, Fa
;
Gao, Xin
;
Li, Guojun
收藏
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浏览/下载:23/0
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提交时间:2023/12/04
Nanopore sequencing
Demultiplexing
Clustering
Correction of image distortion in large-field ssEM stitching by an unsupervised intermediate-space solving network
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 20, 页码: 4797-4805
作者:
He, Bintao
;
Zhang, Yan
;
Zhang, Fa
;
Han, Renmin
收藏
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浏览/下载:19/0
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提交时间:2023/07/12
Divide-and-Attention Network for HE-Stained Pathological Image Classification
期刊论文
BIOLOGY-BASEL, 2022, 卷号: 11, 期号: 7, 页码: 17
作者:
Yan, Rui
;
Yang, Zhidong
;
Li, Jintao
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
pathological image classification
attention mechanism
convolutional neural network
knowledge embedding
Nuclei-Guided Network for Breast Cancer Grading in HE-Stained Pathological Images
期刊论文
SENSORS, 2022, 卷号: 22, 期号: 11, 页码: 15
作者:
Yan, Rui
;
Ren, Fei
;
Li, Jintao
;
Rao, Xiaosong
;
Lv, Zhilong
;
Zheng, Chunhou
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2022/12/07
breast cancer grading
histopathological image
nuclei segmentation
convolutional neural network
attention mechanism
VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms
期刊论文
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, 2022, 卷号: 221, 页码: 14
作者:
Hao, Yu
;
Wan, Xiaohua
;
Yan, Rui
;
Liu, Zhiyong
;
Li, Jintao
;
Zhang, Shihua
;
Cui, Xuefeng
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2023/07/12
Cryo-ET
Sub-tomogram averaging
Particle localization
Particle classification
Convolutional neural networks
Noise-Transfer2Clean: denoising cryo-EM images based on noise modeling and transfer
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 8
作者:
Li, Hongjia
;
Zhang, Hui
;
Wan, Xiaohua
;
Yang, Zhidong
;
Li, Chengmin
;
Li, Jintao
;
Han, Renmin
;
Zhu, Ping
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:28/0
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提交时间:2022/12/07