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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Artificial intelligence and computer-aided drug discovery: Methods development and application
期刊论文
METHODS, 2024, 卷号: 231, 页码: 55-56
作者:
Zhang, Haiping
;
Wei, Yanjie
;
Saravanan, Konda Mani
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提交时间:2024/12/06
DeepBindBC: A practical deep learning method for identifying native-like protein-ligand complexes in virtual screening
期刊论文
METHODS, 2022, 卷号: 205, 页码: 247-262
作者:
Zhang, Haiping
;
Zhang, Tingting
;
Saravanan, Konda Mani
;
Liao, Linbu
;
Wu, Hao
;
Zhang, Haishan
;
Zhang, Huiling
;
Pan, Yi
;
Wu, Xuli
;
Wei, Yanjie
收藏
  |  
浏览/下载:24/0
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提交时间:2023/07/12
Native like protein-ligand
Drug virtual screening
ResNet
Deep learning
Human pancreatic alpha amylase inhibitor
An Efficient Modern Strategy to Screen Drug Candidates Targeting RdRp of SARS-CoV-2 With Potentially High Selectivity and Specificity
期刊论文
FRONTIERS IN CHEMISTRY, 2022, 卷号: 10, 页码: 13
作者:
Zhang, Haiping
;
Gong, Xiaohua
;
Peng, Yun
;
Saravanan, Konda Mani
;
Bian, Hengwei
;
Zhang, John Z. H.
;
Wei, Yanjie
;
Pan, Yi
;
Yang, Yang
收藏
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浏览/下载:33/0
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提交时间:2022/12/07
antiviral agent
RdRp
compound specificity estimation
virtual screening
tubeimoside III
An Integrated Deep Learning and Molecular Dynamics Simulation-Based Screening Pipeline Identifies Inhibitors of a New Cancer Drug Target TIPE2
期刊论文
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2021, 卷号: 12, 页码: 13
作者:
Zhang, Haiping
;
Li, Junxin
;
Saravanan, Konda Mani
;
Wu, Hao
;
Wang, Zhichao
;
Wu, Du
;
Wei, Yanjie
;
Lu, Zhen
;
Chen, Youhai H.
;
Wan, Xiaochun
;
Pan, Yi
收藏
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浏览/下载:38/0
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提交时间:2022/06/21
TIPE2
UM-164
virtual screening
deep learning
molecular dynamics simulation
Identifying the miRNA Signature Association with Aging-Related Senescence in Glioblastoma
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2021, 卷号: 22, 期号: 2, 页码: 14
作者:
Gnanavel, Mutharasu
;
Murugesan, Akshaya
;
Konda Mani, Saravanan
;
Yli-Harja, Olli
;
Kandhavelu, Meenakshisundaram
收藏
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浏览/下载:45/0
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提交时间:2021/12/01
glioblastoma
microRNA
senescence
molecular signaling
biochemical pathways
A novel virtual screening procedure identifies Pralatrexate as inhibitor of SARS-CoV-2 RdRp and it reduces viral replication in vitro
期刊论文
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2020, 卷号: 16, 期号: 12, 页码: 20
作者:
Zhang, Haiping
;
Yang, Yang
;
Li, Junxin
;
Wang, Min
;
Saravanan, Konda Mani
;
Wei, Jinli
;
Ng, Justin Tze-Yang
;
Hossain, Md Tofazzal
;
Liu, Maoxuan
;
Zhang, Huiling
;
Ren, Xiaohu
;
Pan, Yi
;
Peng, Yin
;
Shi, Yi
;
Wan, Xiaochun
;
Liu, Yingxia
;
Wei, Yanjie
收藏
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浏览/下载:48/0
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提交时间:2021/12/01
Transcriptomic analysis of glioblastoma multiforme providing new insights into GPR17 signaling communication
期刊论文
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2020, 页码: 14
作者:
Mutharasu, Gnanavel
;
Murugesan, Akshaya
;
Konda Mani, Saravanan
;
Yli-Harja, Olli
;
Kandhavelu, Meenakshisundaram
收藏
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浏览/下载:57/0
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提交时间:2020/12/10
GPR17
signaling networks
glioblastoma multiforme
RNA-Seq
protein–
protein interface
kinases
Structural basis for the inhibition of SARS-CoV2 main protease by Indian medicinal plant-derived antiviral compounds
期刊论文
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2020, 页码: 9
作者:
Saravanan, Konda Mani
;
Zhang, Haiping
;
Senthil, Renganathan
;
Vijayakumar, Kevin Kumar
;
Sounderrajan, Vignesh
;
Wei, Yanjie
;
Shakila, Harshavardhan
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浏览/下载:105/0
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提交时间:2020/12/10
SARS-CoV2
main protease
medicinal plants
molecular docking and dynamics
drug design
Deep Learning Based Drug Screening for Novel Coronavirus 2019-nCov
期刊论文
INTERDISCIPLINARY SCIENCES-COMPUTATIONAL LIFE SCIENCES, 2020, 页码: 9
作者:
Zhang, Haiping
;
Saravanan, Konda Mani
;
Yang, Yang
;
Hossain, Md Tofazzal
;
Li, Junxin
;
Ren, Xiaohu
;
Pan, Yi
;
Wei, Yanjie
收藏
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浏览/下载:61/0
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提交时间:2020/12/10
Coronavirus
Deep learning
Drug screening
Homology modeling
3C-like protease
A novel machine learning based approach for iPS progenitor cell identification
期刊论文
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 卷号: 15, 期号: 12, 页码: 19
作者:
Zhang, Haishan
;
Shao, Ximing
;
Peng, Yin
;
Teng, Yanning
;
Saravanan, Konda Mani
;
Zhang, Huiling
;
Li, Hongchang
;
Wei, Yanjie
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2020/12/10