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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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作者:Wan, Xiaohua
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VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms
期刊论文
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, 2022, 卷号: 221, 页码: 14
作者:
Hao, Yu
;
Wan, Xiaohua
;
Yan, Rui
;
Liu, Zhiyong
;
Li, Jintao
;
Zhang, Shihua
;
Cui, Xuefeng
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:14/0
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提交时间:2023/07/12
Cryo-ET
Sub-tomogram averaging
Particle localization
Particle classification
Convolutional neural networks
AuTom-dualx: a toolkit for fully automatic fiducial marker-based alignment of dual-axis tilt series with simultaneous reconstruction
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 2, 页码: 319-328
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Li, Lun
;
Lawrence, Albert
;
Yang, Peng
;
Li, Yu
;
Wang, Sheng
;
Sun, Fei
;
Liu, Zhiyong
;
Gao, Xin
;
Zhang, Fa
收藏
  |  
浏览/下载:74/0
  |  
提交时间:2019/04/03
ICON-MIC: Implementing a CPU/MIC Collaboration Parallel Framework for ICON on Tianhe-2 Supercomputer
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2017, 页码: 12
作者:
Wang, Zihao
;
Chen, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Li, Lun
;
Wan, Xiaohua
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
  |  
浏览/下载:61/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
hybrid task allocation strategy
ICON
MIC acceleration
parallel NUFFT
Tianhe-2 supercomputer
AuTom: A novel automatic platform for electron tomography reconstruction
期刊论文
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 199, 期号: 3, 页码: 196-208
作者:
Han, Renmin
;
Wan, Xiaohua
;
Wang, Zihao
;
Hao, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Chen, Yu
;
Gao, Xin
;
Liu, Zhiyong
;
Ren, Fei
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2019/12/12
Electron tomography
Alignment
Reconstruction
Image processing workflow
A Two-Phase Improved Correlation Method for Automatic Particle Selection in Cryo-EM
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 14, 期号: 2, 页码: 316-325
作者:
Zhang, Fa
;
Chen, Yu
;
Ren, Fei
;
Wang, Xuan
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
收藏
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浏览/下载:58/0
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提交时间:2019/12/12
Particle selection
feature-based
template-matching
rotation-invariant feature
correlation score functions