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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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中国科学院计算技术... [27]
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GPCR-BSD: a database of binding sites of human G-protein coupled receptors under diverse states
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2024, 卷号: 25, 期号: 1, 页码: 16
作者:
Liu, Fan
;
Zhou, Han
;
Li, Xiaonong
;
Zhou, Liangliang
;
Yu, Chungong
;
Zhang, Haicang
;
Bu, Dongbo
;
Liang, Xinmiao
收藏
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浏览/下载:1/0
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提交时间:2024/12/06
G-protein coupled receptor
State-specific structure
Binding site
Key residue
Database
ESA: An efficient sequence alignment algorithm for biological database search on Sunway TaihuLight
期刊论文
PARALLEL COMPUTING, 2023, 卷号: 117, 页码: 11
作者:
Zhang, Hao
;
Huang, Zhiyi
;
Chen, Yawen
;
Liang, Jianguo
;
Gao, Xiran
收藏
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浏览/下载:16/0
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提交时间:2023/12/04
Hybrid sequence alignment
Biological database search
Sunway TaihuLight
SW26010
Heterogeneous architecture
DOE: database offloading engine for accelerating SQL processing
期刊论文
DISTRIBUTED AND PARALLEL DATABASES, 2023, 页码: 25
作者:
Kong, Hao
;
Lu, Wenyan
;
Chen, Yan
;
Wu, Jingya
;
Zhang, Yu
;
Yan, Guihai
;
Li, Xiaowei
收藏
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浏览/下载:18/0
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提交时间:2023/12/04
Database
Hardware
software co-design
Heterogeneous system
Analytic query processing
dbDEMC 3.0: Functional Exploration of Differentially Expressed miRNAs in Cancers of Human and Model Organisms
期刊论文
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 20, 期号: 3, 页码: 446-454
作者:
Xu, Feng
;
Wang, Yifan
;
Ling, Yunchao
;
Zhou, Chenfen
;
Wang, Haizhou
;
Teschendorff, Andrew E.
;
Zhao, Yi
;
Zhao, Haitao
;
He, Yungang
;
Zhang, Guoqing
;
Yang, Zhen
收藏
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浏览/下载:24/0
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提交时间:2023/07/12
MicroRNA
Cancer
Differential expression
Model organism
Database
Application-Oriented Data Migration to Accelerate In-Memory Database on Hybrid Memory
期刊论文
MICROMACHINES, 2022, 卷号: 13, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Zhao, Wenze
;
Du, Yajuan
;
Zhang, Mingzhe
;
Liu, Mingyang
;
Jin, Kailun
;
Ausavarungnirun, Rachata
收藏
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浏览/下载:27/0
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提交时间:2022/12/07
in-memory database
hybrid memory
data migration
CanImmunother: a manually curated database for identification of cancer immunotherapies associating with biomarkers, targets, and clinical effects
期刊论文
ONCOIMMUNOLOGY, 2021, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 12
作者:
Zhang, Wenliang
;
Zeng, Binghui
;
Lin, Huancai
;
Guan, Wen
;
Mo, Jing
;
Wu, Song
;
Wei, Yanjie
;
Zhang, Qianshen
;
Yu, Dongsheng
;
Li, Weizhong
;
Chan, Godfrey Chi-Fung
收藏
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浏览/下载:44/0
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提交时间:2021/12/01
Cancer immunotherapy
immune checkpoint
database
biomarker
tumor vaccine
SAHA: A String Adaptive Hash Table for Analytical Databases
期刊论文
APPLIED SCIENCES-BASEL, 2020, 卷号: 10, 期号: 6, 页码: 18
作者:
Zheng, Tianqi
;
Zhang, Zhibin
;
Cheng, Xueqi
收藏
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2020/12/10
hash table
analytical database
string data
CMTTdb: the cancer molecular targeted therapy database
期刊论文
ANNALS OF TRANSLATIONAL MEDICINE, 2019, 卷号: 7, 期号: 22, 页码: 7
作者:
Bai, Xue
;
Yang, Xiaobo
;
Wu, Liangcai
;
Zuo, Bangyou
;
Lin, Jianzhen
;
Wang, Shanshan
;
Bian, Jin
;
Sang, Xinting
;
He, Yungang
;
Yang, Zhen
;
Zhao, Haitao
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浏览/下载:52/0
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提交时间:2020/12/10
Molecular-targeted therapy
clinical trial
cancer
database
Indexing Techniques of Distributed Ordered Tables: A Survey and Analysis
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2018, 卷号: 33, 期号: 1, 页码: 169-189
作者:
Feng, Chen
;
Li, Chun-Dian
;
Li, Rui
收藏
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浏览/下载:42/0
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提交时间:2019/12/10
database
Not Only SQL (NoSQL)
range query
indexing
TagDict: Prediction of Theoretical Spectra of Peptides Based on A Tag Dictionary
期刊论文
CURRENT BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 13, 期号: 5, 页码: 444-449
作者:
Wang, Yaojun
;
Zhang, Jingwei
;
Bu, Dongbo
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载:73/0
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提交时间:2019/12/10
Mass spectrometry
theoretical spectrum prediction
database search
peptide identification
TagDict
MassAnalyzer