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中国科学院计算技术研究所机构知识库
Institute of Computing Technology, Chinese Academy IR
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TransSurv: Transformer-Based Survival Analysis Model Integrating Histopathological Images and Genomic Data for Colorectal Cancer
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 20, 期号: 6, 页码: 3411-3420
作者:
Lv, Zhilong
;
Lin, Yuexiao
;
Yan, Rui
;
Wang, Ying
;
Zhang, Fa
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浏览/下载:42/0
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提交时间:2024/05/20
Cancer
Genomics
Bioinformatics
Transformers
Tumors
Feature extraction
Prognostics and health management
Survival analysis
multi-modal learning
transformer
histopathological slides
genomic data
Disclosing Potential Key Genes, Therapeutic Targets and Agents for Non-Small Cell Lung Cancer: Evidence from Integrative Bioinformatics Analysis
期刊论文
VACCINES, 2022, 卷号: 10, 期号: 5, 页码: 20
作者:
Mosharaf, Md Parvez
;
Reza, Md Selim
;
Gov, Esra
;
Mahumud, Rashidul Alam
;
Mollah, Md Nurul Haque
收藏
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浏览/下载:29/0
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提交时间:2022/12/07
non-small cell lung cancer
gene expression profiles
molecular signatures
therapeutic targets and agents
integrated bioinformatics approaches
Bioinformatics Screening of Potential Biomarkers from mRNA Expression Profiles to Discover Drug Targets and Agents for Cervical Cancer
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2022, 卷号: 23, 期号: 7, 页码: 21
作者:
Reza, Md Selim
;
Harun-Or-Roshid, Md
;
Islam, Md Ariful
;
Hossen, Md Alim
;
Hossain, Md Tofazzal
;
Feng, Shengzhong
;
Xi, Wenhui
;
Mollah, Md Nurul Haque
;
Wei, Yanjie
收藏
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浏览/下载:28/0
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提交时间:2022/12/07
cervical cancer
mRNA expression profiles
key genes
candidate drugs
integrated bioinformatics analysis
Deep Learning in Proteomics
期刊论文
PROTEOMICS, 2020, 页码: 21
作者:
Wen, Bo
;
Zeng, Wen-Feng
;
Liao, Yuxing
;
Shi, Zhiao
;
Savage, Sara R.
;
Jiang, Wen
;
Zhang, Bing
收藏
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浏览/下载:37/0
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提交时间:2021/12/01
bioinformatics
deep learning
proteomics
Top-down Proteomics: The Large-scale Proteoform Identification
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2015, 卷号: 42, 期号: 2, 页码: 101
作者:
Sun RX(孙瑞祥)
;
Luo L(罗兰)
;
Chi H(迟浩)
;
Liu C(刘超)
;
He SM(贺思敏)
收藏
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浏览/下载:14/0
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提交时间:2023/12/04
DISSOCIATION MASS-SPECTROMETRY
ELECTRON-CAPTURE DISSOCIATION
CHARGED PROTEIN CATIONS
INTACT PROTEINS
BOTTOM-UP
PEPTIDE IDENTIFICATION
MONOCLONAL-ANTIBODIES
STRUCTURAL-ANALYSIS
MEMBRANE-PROTEINS
YEAST PROTEOME
top-down proteomics
tandem mass spectrometry
bioinformatics
protein identification
A reconfigurable accelerator for Smith-Waterman algorithm
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON CIRCUITS AND SYSTEMS II-EXPRESS BRIEFS, 2007, 卷号: 54, 期号: 12, 页码: 1077-1081
作者:
Jiang, Xianyang
;
Liu, Xinchun
;
Xu, Lin
;
Zhang, Peiheng
;
Sun, Ninghui
收藏
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浏览/下载:44/0
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提交时间:2019/12/16
bioinformatics
computational complexity
field-programmable gate array (FPGA)
reconfigurable accelerator
Smith-Waterman (SW) algorithm
A study of architectural optimization methods in bioinformatics applications
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS, 2007, 卷号: 21, 期号: 3, 页码: 371-384
作者:
Tan, G.
;
Xu, L.
;
Dai, Z.
;
Fong, S.
;
Sun, N.
收藏
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浏览/下载:43/0
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提交时间:2019/12/16
bioinformatics
sequence alignment
cache memory
instruction level parallelism
I/O overlapping
A reconfigurable index FLASH memory tailored to seed-based genomic sequence comparison algorithms
期刊论文
JOURNAL OF VLSI SIGNAL PROCESSING SYSTEMS FOR SIGNAL IMAGE AND VIDEO TECHNOLOGY, 2007, 卷号: 48, 期号: 3, 页码: 255-269
作者:
Lavenier, D.
;
Georges, G.
;
Liu, X.
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浏览/下载:40/0
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提交时间:2019/12/16
bioinformatics
genomics
sequence comparison
reconfigurable architecture
FLASH memory
index
indexing
seed-based algorithm
Survey on index based homology search algorithms
期刊论文
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, 2007, 卷号: 40, 期号: 2, 页码: 185-212
作者:
Jiang, Xianyang
;
Zhang, Peiheng
;
Liu, Xinchun
;
Yau, Stephen S-T.
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浏览/下载:41/0
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提交时间:2019/12/16
algorithm
bioinformatics
genomic indexing
homology search
sequence alignment
SiRNA designs to the crucial proteins of SARS coronavirus
期刊论文
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2003, 卷号: 30, 期号: 3, 页码: 335-338
作者:
Zhang, Y
;
Xu, JY
;
Deng, W
;
Zhang, N
;
Cai, L
;
Zhao, Y
;
Bu, D
;
Chen, RS
收藏
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浏览/下载:99/0
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提交时间:2019/12/16
SARS coronavirus (SARS-CoV)
RNA interference (RNAi)
small interfering RNA (siRNA)
bioinformatics