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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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A high-speed search engine pLink 2 with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 卷号: 10, 页码: 12
作者:
Chen, Zhen-Lin
;
Meng, Jia-Ming
;
Cao, Yong
;
Yin, Ji-Li
;
Fang, Run-Qian
;
Fan, Sheng-Bo
;
Liu, Chao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Ding, Yue-He
;
Tan, Dan
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Dong, Meng-Qiu
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/10
pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2019, 卷号: 18, 期号: 7, 页码: 2747-2758
作者:
Zhou, Wen-Jing
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Zhang, Kun
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:256/0
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提交时间:2019/08/16
tandem mass spectrometry
target-decoy approach
validation methods
false-positive rate
false-negative rate
Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine
期刊论文
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2018, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 1059-+
作者:
Chi, Hao
;
Liu, Chao
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Wang, Rui-Min
;
Niu, Xiu-Nan
;
Ding, Yue-He
;
Zhang, Yao
;
Wang, Zhao-Wei
;
Chen, Zhen-Lin
;
Sun, Rui-Xiang
;
Liu, Tao
;
Tan, Guang-Ming
;
Dong, Meng-Qiu
;
Xu, Ping
;
Zhang, Pei-Heng
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:95/0
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提交时间:2019/08/16
Increasing the Depth of Mass-Spectrometry-Based Structural Analysis of Protein Complexes through the Use of Multiple Cross-Linkers
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2016, 卷号: 88, 期号: 8, 页码: 4461-4469
作者:
Ding, Yue-He
;
Fan, Sheng-Bo
;
Li, Shuang
;
Feng, Bo-Ya
;
Gao, Ning
;
Ye, Keqiong
;
He, Si-Min
;
Dong, Meng-Qiu
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提交时间:2019/12/13