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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Macromolecules Structural Classification With a 3D Dilated Dense Network in Cryo-Electron Tomography
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 19, 期号: 1, 页码: 209-219
作者:
Gao, Shan
;
Han, Renmin
;
Zeng, Xiangrui
;
Liu, Zhiyong
;
Xu, Min
;
Zhang, Fa
收藏
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提交时间:2022/12/07
Cryo-electron tomography
image classification
convolution neural network
SHREC 2020: Classification in cryo-electron tomograms
期刊论文
COMPUTERS & GRAPHICS-UK, 2020, 卷号: 91, 页码: 279-289
作者:
Gubins, Ilja
;
Chaillet, Marten L.
;
van der Schot, Gijs
;
Veltkamp, Remco C.
;
Forster, Friedrich
;
Hao, Yu
;
Wan, Xiaohua
;
Cui, Xuefeng
;
Zhang, Fa
;
Moebel, Emmanuel
;
Wang, Xiao
;
Kihara, Daisuke
;
Zeng, Xiangrui
;
Xu, Min
;
Nguyen, Nguyen P.
;
White, Tommi
;
Bunyak, Filiz
收藏
  |  
浏览/下载:66/0
  |  
提交时间:2020/12/10
Cryo-electron tomography
Computer vision
Pattern recognition
Protein classification
Benchmark
Spark-based parallel calculation of 3D fourier shell correlation for macromolecule structure local resolution estimation
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 页码: 18
作者:
Lue, Yongchun
;
Zeng, Xiangrui
;
Tian, Xinhui
;
Shi, Xiao
;
Wang, Hui
;
Zheng, Xiaohui
;
Liu, Xiaodong
;
Zhao, Xiaofang
;
Gao, Xin
;
Xu, Min
收藏
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浏览/下载:62/0
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提交时间:2020/12/10
3D local Fourier shell correlation
3D local resolution map
Key-value data
Spark
3D array partition
Fine-grained alignment of cryo-electron subtomograms based on MPI parallel optimization
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Lu, Yongchun
;
Zeng, Xiangrui
;
Zhao, Xiaofang
;
Li, Shirui
;
Li, Hua
;
Gao, Xin
;
Xu, Min
收藏
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浏览/下载:83/0
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提交时间:2019/12/10
Stochastic average gradient
Fine-grained alignment
Cryo-ET
MPI