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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Synergistic optimization of Liquid Chromatography and Mass Spectrometry parameters on Orbitrap Tribrid mass spectrometer for high efficient data-dependent proteomics
期刊论文
JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY, 2020, 页码: 10
作者:
Huang, Peiwu
;
Liu, Chao
;
Gao, Weina
;
Chu, Bizhu
;
Cai, Zongwei
;
Tian, Ruijun
收藏
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浏览/下载:73/0
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提交时间:2020/12/10
chromatography
data-dependent acquisition
label-free proteomics
mass spectrometry
precursor determination algorithm
N-glycopeptide Signatures of IgA(2) in Serum from Patients with Hepatitis B Virus-related Liver Diseases
期刊论文
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, 2019, 卷号: 18, 期号: 11, 页码: 2262-2272
作者:
Zhang, Shu
;
Cao, Xinyi
;
Liu, Chao
;
Li, Wei
;
Zeng, Wenfeng
;
Li, Baiwen
;
Chi, Hao
;
Liu, Mingqi
;
Qin, Xue
;
Tang, Lingyi
;
Yan, Guoquan
;
Ge, Zefan
;
Liu, Yinkun
;
Gao, Qiang
;
Lu, Haojie
收藏
  |  
浏览/下载:63/0
  |  
提交时间:2020/12/10
A high-speed search engine pLink 2 with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 卷号: 10, 页码: 12
作者:
Chen, Zhen-Lin
;
Meng, Jia-Ming
;
Cao, Yong
;
Yin, Ji-Li
;
Fang, Run-Qian
;
Fan, Sheng-Bo
;
Liu, Chao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Ding, Yue-He
;
Tan, Dan
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Dong, Meng-Qiu
;
He, Si-Min
收藏
  |  
浏览/下载:102/0
  |  
提交时间:2019/12/10
Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine
期刊论文
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2018, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 1059-+
作者:
Chi, Hao
;
Liu, Chao
;
Yang, Hao
;
Zeng, Wen-Feng
;
Wu, Long
;
Zhou, Wen-Jing
;
Wang, Rui-Min
;
Niu, Xiu-Nan
;
Ding, Yue-He
;
Zhang, Yao
;
Wang, Zhao-Wei
;
Chen, Zhen-Lin
;
Sun, Rui-Xiang
;
Liu, Tao
;
Tan, Guang-Ming
;
Dong, Meng-Qiu
;
Xu, Ping
;
Zhang, Pei-Heng
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:95/0
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提交时间:2019/08/16
pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2018, 卷号: 17, 期号: 1, 页码: 119-128
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
Liu, Chao
;
Wang, Rui-Min
;
Wang, Zhao-Wei
;
Niu, Xiu-Nan
;
Chen, Zhen-Lin
;
He, Si-Min
收藏
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浏览/下载:82/0
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提交时间:2019/12/10
tandem mass spectrometry
de novo peptide sequencing
modification site localization
phosphorylation
pDeep: Predicting MS/MS Spectra of Peptides with Deep Learning
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2017, 卷号: 89, 期号: 23, 页码: 12690-12697
作者:
Zhou, Xie-Xuan
;
Zeng, Wen-Feng
;
Chi, Hao
;
Luo, Chunjie
;
Liu, Chao
;
Zhan, Jianfeng
;
He, Si-Min
;
Zhang, Zhifei
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浏览/下载:77/0
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提交时间:2019/12/10
pGlyco 2.0 enables precision N-glycoproteomics with comprehensive quality control and one-step mass spectrometry for intact glycopeptide identification
期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2017, 卷号: 8, 页码: 14
作者:
Liu, Ming-Qi
;
Zeng, Wen-Feng
;
Fang, Pan
;
Cao, Wei-Qian
;
Liu, Chao
;
Yan, Guo-Quan
;
Zhang, Yang
;
Peng, Chao
;
Wu, Jian-Qiang
;
Zhang, Xiao-Jin
;
Tu, Hui-Jun
;
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Cao, Yong
;
Dong, Meng-Qiu
;
Jiang, Bi-Yun
;
Huang, Jiang-Ming
;
Shen, Hua-Li
;
Wong, Catherine C. L.
;
He, Si-Min
;
Yang, Peng-Yuan
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提交时间:2019/12/12
Immunopurification and Mass Spectrometry Identifies Protein Phosphatase 2A (PP2A) and BIN2/GSK3 as Regulators of AKS Transcription Factors in Arabidopsis
期刊论文
MOLECULAR PLANT, 2017, 卷号: 10, 期号: 2, 页码: 345-348
作者:
Bu, Shuo-Lei
;
Liu, Chao
;
Liu, Ning
;
Zhao, Ji-Long
;
Ai, Lian-Feng
;
Chi, Hao
;
Li, Kathy L.
;
Chien, Chih-Wei
;
Burlingame, Alma L.
;
Zhang, Sheng-Wei
;
Wang, Zhi-Yong
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浏览/下载:73/0
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提交时间:2019/12/12
Open-pNovo: De Novo Peptide Sequencing with Thousands of Protein Modifications
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2017, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 645-654
作者:
Yang, Hao
;
Chi, Hao
;
Zhou, Wen-Jing
;
Zeng, Wen-Feng
;
He, Kun
;
Liu, Chao
;
Sun, Rui-Xiang
;
He, Si-Min
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浏览/下载:58/0
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提交时间:2019/12/12
tandem mass spectrometry
de novo peptide sequencing
dynamic programming
unexpected modifications
Modeling Protein Excited-state Structures from "Over-length" Chemical Cross-links
期刊论文
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2017, 卷号: 292, 期号: 4, 页码: 1187-1196
作者:
Ding, Yue-He
;
Gong, Zhou
;
Dong, Xu
;
Liu, Kan
;
Liu, Zhu
;
Liu, Chao
;
He, Si-Min
;
Dong, Meng-Qiu
;
Tang, Chun
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提交时间:2019/12/12