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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Attention-Guided Residual U-Net with SE Connection and ASPP for Watershed-Based Cell Segmentation in Microscopy Images
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2024, 页码: 13
作者:
Niyogisubizo, Jovial
;
Zhao, Keliang
;
Meng, Jintao
;
Pan, Yi
;
Didi, Rosiy Adi
;
Wei, Yanjie
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提交时间:2024/12/06
cell segmentation
deep learning
watershed segmentation
bright-field microscopy
iPS cell reprogramming
attention mechanism
Improved Denoising of Cryo-Electron Microscopy Micrographs with Simulation-Aware Pretraining
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2024, 页码: 12
作者:
Yang, Zhidong
;
Li, Hongjia
;
Zang, Dawei
;
Han, Renmin
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:1/0
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提交时间:2024/12/06
cryo-EM
image denoising
noise simulation and deep learning
ProALIGN: Directly Learning Alignments for Protein Structure Prediction via Exploiting Context-Specific Alignment Motifs
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022, 页码: 14
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zheng, Wei-mou
;
Zhu, Jianwei
;
Sun, Shiwei
;
Xu, Jinbo
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:26/0
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提交时间:2022/12/07
deep learning and protein threading
protein alignment
protein structure prediction
SVLR: Genome Structural Variant Detection Using Long-Read Sequencing Data
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2021, 页码: 15
作者:
Gu, Wenyan
;
Zhou, Aizhong
;
Wang, Lusheng
;
Sun, Shiwei
;
Cui, Xuefeng
;
Zhu, Daming
收藏
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浏览/下载:47/0
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提交时间:2021/12/01
genome structural variant
genome structural variant detection
long-read sequencing and single-molecule sequencing
third-generation sequencing
A Consensus Framework of Distributed Multiple-Tilt Reconstruction in Electron Tomography
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 页码: 11
作者:
Wang, Zihao
;
Zhang, Jingrong
;
Gao, Weifang
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:51/0
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提交时间:2020/12/10
consensus optimization
cryoelectron tomography
multiple-tilt reconstruction
parallel computing
TxBR
ICON-MIC: Implementing a CPU/MIC Collaboration Parallel Framework for ICON on Tianhe-2 Supercomputer
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2017, 页码: 12
作者:
Wang, Zihao
;
Chen, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Li, Lun
;
Wan, Xiaohua
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:67/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
hybrid task allocation strategy
ICON
MIC acceleration
parallel NUFFT
Tianhe-2 supercomputer
LEX-SVM: EXPLORING THE POTENTIAL OF EXON EXPRESSION PROFILING FOR DISEASE CLASSIFICATION
期刊论文
JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2011, 卷号: 9, 期号: 2, 页码: 299-316
作者:
Yuan, Xiongying
;
Zhao, Yi
;
Liu, Changning
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2019/12/16
Alternative splicing
Affymetrix exon array
RNA-Seq
exon expression profile classification
regularized SVM