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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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作者:Wu, Yang分Wu, Yang
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DeepFusion: A deep bimodal information fusion network for unraveling protein-RNA interactions using in vivo RNA structures
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 卷号: 23, 页码: 617-625
作者:
Qiao, Yixuan
;
Yang, Rui
;
Liu, Yang
;
Chen, Jiaxin
;
Zhao, Lianhe
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Zhao, Yi
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浏览/下载:5/0
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提交时间:2024/05/20
Information fusion
Deep learning
RNA -binding proteins
In vivo RNA structures
Motifs
Biological knowledge graph-guided investigation of immune therapy response in cancer with graph neural network
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 24, 期号: 2, 页码: 9
作者:
Zhao, Lianhe
;
Qi, Xiaoning
;
Chen, Yang
;
Qiao, Yixuan
;
Bu, Dechao
;
Wu, Yang
;
Luo, Yufan
;
Wang, Sheng
;
Zhang, Rui
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:9/0
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提交时间:2023/12/04
immune checkpoints inhibitors
deep learning
graph neural networks
Systematic Survey of the Alteration of the Faecal Microbiota in Rats With Gastrointestinal Disorder and Modulation by Multicomponent Drugs
期刊论文
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2021, 卷号: 12, 页码: 13
作者:
Wu, Yue
;
Wu, Yang
;
Wu, Hongwei
;
Wu, Changxun
;
Ji, Enhui
;
Xu, Jing
;
Zhang, Yi
;
Wei, Junying
;
Zhao, Yi
;
Yang, Hongjun
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浏览/下载:29/0
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提交时间:2022/06/21
XEFP
functional dyspepsia
intestinal flora
metabonomics
network pharmacology
High Throughput Transcriptome Data Analysis and Computational Verification Reveal Immunotherapy Biomarkers of Compound Kushen Injection for Treating Triple-Negative Breast Cancer
期刊论文
FRONTIERS IN ONCOLOGY, 2021, 卷号: 11, 页码: 23
作者:
Liu, Xinkui
;
Wu, Yang
;
Zhang, Yingying
;
Bu, Dechao
;
Wu, Chao
;
Lu, Shan
;
Huang, Zhihong
;
Song, Yurong
;
Zhao, Yi
;
Guo, Fengying
;
Ye, Peizhi
;
Fu, Changgeng
;
Shen, Liangliang
;
Zhang, Jingyuan
;
Wang, Haojia
;
Duan, Xianchun
;
Wu, Jiarui
收藏
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2022/06/21
compound kushen injection
triple-negative breast cancer
RNA sequencing
tumor microenvironment
prognostic signature
ncFANs v2.0: an integrative platform for functional annotation of non-coding RNAs
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: W1, 页码: W459-W468
作者:
Zhang, Yuwei
;
Bu, Dechao
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Rong, Hao
;
Li, Yanguo
;
Liu, Jingjia
;
Ye, Meng
;
Wu, Yang
;
Jiang, Zheng
;
Liao, Qi
;
Zhao, Yi
收藏
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浏览/下载:38/0
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提交时间:2021/12/01
KOBAS-i: intelligent prioritization and exploratory visualization of biological functions for gene enrichment analysis
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: W1, 页码: W317-W325
作者:
Bu, Dechao
;
Luo, Haitao
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
Zhang, Shan
;
He, Zihao
;
Wu, Yang
;
Zhao, Lianhe
;
Liu, Jingjia
;
Guo, Jincheng
;
Fang, Shuangsang
;
Cao, Wanchen
;
Yi, Lan
;
Zhao, Yi
;
Kong, Lei
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浏览/下载:57/0
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提交时间:2021/12/01
NONCODEV6: an updated database dedicated to long non-coding RNA annotation in both animals and plants
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D165-D171
作者:
Zhao, Lianhe
;
Wang, Jiajia
;
Li, Yanyan
;
Song, Tingrui
;
Wu, Yang
;
Fang, Shuangsang
;
Bu, Dechao
;
Li, Hui
;
Sun, Liang
;
Pei, Dong
;
Zheng, Yu
;
Huang, Jianqin
;
Xu, Mingqing
;
Chen, Runsheng
;
Zhao, Yi
;
He, Shunmin
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提交时间:2021/12/01
HERB: a high-throughput experiment- and reference-guided database of traditional Chinese medicine
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2021, 卷号: 49, 期号: D1, 页码: D1197-D1206
作者:
Fang, ShuangSang
;
Dong, Lei
;
Liu, Liu
;
Guo, JinCheng
;
Zhao, LianHe
;
Zhang, JiaYuan
;
Bu, DeChao
;
Liu, XinKui
;
Huo, PeiPei
;
Cao, WanChen
;
Dong, QiongYe
;
Wu, JiaRui
;
Zeng, Xiaoxi
;
Wu, Yang
;
Zhao, Yi
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浏览/下载:41/0
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提交时间:2021/12/01
A network-based machine-learning framework to identify both functional modules and disease genes
期刊论文
HUMAN GENETICS, 2021, 页码: 17
作者:
Yang, Kuo
;
Lu, Kezhi
;
Wu, Yang
;
Yu, Jian
;
Liu, Baoyan
;
Zhao, Yi
;
Chen, Jianxin
;
Zhou, Xuezhong
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浏览/下载:32/0
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提交时间:2021/12/01
FangNet: Mining herb hidden knowledge from TCM clinical effective formulas using structure network algorithm
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2021, 卷号: 19, 页码: 62-71
作者:
Bu, Dechao
;
Xia, Yan
;
Zhang, JiaYuan
;
Cao, Wanchen
;
Huo, Peipei
;
Wang, Zhihao
;
He, Zihao
;
Ding, Linyi
;
Wu, Yang
;
Zhang, Shan
;
Gao, Kai
;
Yu, He
;
Liu, Tiegang
;
Ding, Xia
;
Gu, Xiaohong
;
Zhao, Yi
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提交时间:2021/12/01
Formulas
Herb
Symptom
TCM