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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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共8条,第1-8条
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收录类别:SCI
作者:Bu, Dongbo
第一作者
作者:Sun, Shiwei
语种:英语
资助项目:National Key Research and Development Program of China[2018YFC0910405]
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Microbiome Resilience and Health Implications for People in Half-Year Travel
期刊论文
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2022, 卷号: 13, 页码: 15
作者:
Cheng, Mingyue
;
Liu, Hong
;
Han, Maozhen
;
Li, Shuai Cheng
;
Bu, Dongbo
;
Sun, Shiwei
;
Hu, Zhiqiang
;
Yang, Pengshuo
;
Wang, Rui
;
Liu, Yawen
;
Chen, Feng
;
Peng, Jianjun
;
Peng, Hong
;
Song, Hongxing
;
Xia, Yang
;
Chu, Liqun
;
Zhou, Quan
;
Guan, Feng
;
Wu, Jing
;
Tan, Guangming
;
Ning, Kang
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浏览/下载:24/0
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提交时间:2022/12/07
travel
enterotype
microbiome
bi-directional plasticity
resilience
dietary shift
immunity
health
HepParser: An Intelligent Software Program for Deciphering Low-Molecular-Weight Heparin Based on Mass Spectrometry
期刊论文
FRONTIERS IN CHEMISTRY, 2021, 卷号: 9, 页码: 13
作者:
Wang, Hui
;
Wang, Yu
;
Hou, Meijie
;
Zhang, Chunming
;
Wang, Yaojun
;
Guo, Zhendong
;
Bu, Dongbo
;
Li, Yan
;
Huang, Chuncui
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载:37/0
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提交时间:2021/12/01
LMWHs
mass spectrometry
glycosaminoglycans
isotopic distribution
computational method
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:31/0
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提交时间:2021/12/01
Protein structure
Secondary structure elements
Inter-SSE contacts
Identification of glycan branching patterns using multistage mass spectrometry with spectra tree analysis
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOMICS, 2020, 卷号: 217, 页码: 7
作者:
Wang, Hui
;
Zhang, Jingwei
;
Dong, Junchuan
;
Hou, Meijie
;
Pan, Weiyi
;
Bu, Dongbo
;
Zhou, Jinyu
;
Zhang, Qi
;
Wang, Yaojun
;
Zhao, Keli
;
Li, Yan
;
Huang, Chuncui
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载:59/0
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提交时间:2020/12/10
Multi-stage mass spectrometry
Glycan branching pattern
Glycan identification
Spectra tree
Isomeric glycan
Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 11
作者:
Zhang, Haicang
;
Zhang, Qi
;
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Gao, Yujuan
;
Xie, Ziwei
;
Deng, Minghua
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:47/0
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提交时间:2020/12/10
Residue-residue contacts prediction
Deep learning
Markov random fields
Composite likelihood maximization
Best-first search guided multistage mass spectrometry-based glycan identification
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 17, 页码: 2991-2997
作者:
Wang, Yaojun
;
Bu, Dongbo
;
Huang, Chuncui
;
Wang, Hui
;
Zhou, Jinyu
;
Dong, Junchuan
;
Pan, Weiyi
;
Zhang, Jingwei
;
Zhang, Qi
;
Li, Yan
;
Sun, Shiwei
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浏览/下载:84/0
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提交时间:2019/12/10
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 10
作者:
Wang, Chao
;
Wei, Yi
;
Zhang, Haicang
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
收藏
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浏览/下载:81/0
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提交时间:2019/08/16
Protein structure prediction
Energy function
Attraction-basin
Reverse Monte Carlo sampling
Monte Carlo search
Linear program
Toward Automated Identification of Glycan Branching Patterns Using Multistage Mass Spectrometry with Intelligent Precursor Selection
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2018, 卷号: 90, 期号: 24, 页码: 14412-14422
作者:
Sun, Shiwei
;
Huang, Chuncui
;
Wang, Yaojun
;
Liu, Yaming
;
Zhang, Jingwei
;
Zhou, Jinyu
;
Gao, Feng
;
Yang, Fei
;
Chen, Runsheng
;
Mulloy, Barbara
;
Chai, Wengang
;
Li, Yan
;
Bu, Dongbo
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浏览/下载:253/0
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提交时间:2019/04/03