中国科学院计算技术研究所机构知识库

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限定条件	作者：Zeng, Wen-Feng    第一作者

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	Validation Methods of Peptide Identification Results in Proteomics br 期刊论文 PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2023, 卷号: 50, 期号: 1, 页码: 109-125 作者:  Zhou, Wen-Jing;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：23/0  |  提交时间：2023/12/04 proteomics  mass spectrometry  target-decoy approach  false discovery rate  validation methods
	Deep Learning in Proteomics 期刊论文 PROTEOMICS, 2020, 页码: 21 作者:  Wen, Bo;  Zeng, Wen-Feng;  Liao, Yuxing;  Shi, Zhiao;  Savage, Sara R.;  Jiang, Wen;  Zhang, Bing 收藏  |  浏览/下载：30/0  |  提交时间：2021/12/01 bioinformatics  deep learning  proteomics
	A Deep Learning-Based Tumor Classifier Directly Using MS Raw Data 期刊论文 PROTEOMICS, 2020, 页码: 7 作者:  Dong, Hao;  Liu, Yi;  Zeng, Wen-Feng;  Shu, Kunxian;  Zhu, Yunping;  Chang, Cheng 收藏  |  浏览/下载：59/0  |  提交时间：2020/12/10 deep learning  MS data  proteomics  tumor classifier
	MS/MS Spectrum Prediction for Modified Peptides Using pDeep2 Trained by Transfer Learning 期刊论文 ANALYTICAL CHEMISTRY, 2019, 卷号: 91, 期号: 15, 页码: 9724-9731 作者:  Zeng, Wen-Feng;  Zhou, Xie-Xuan;  Zhou, Wen-Jing;  Chi, Hao;  Zhan, Jianfeng;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：77/0  |  提交时间：2019/12/10
	pNovo 3: precise de novo peptide sequencing using a learning-to-rank framework 期刊论文 BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 14, 页码: I183-I190 作者:  Yang, Hao;  Chi, Hao;  Zeng, Wen-Feng;  Zhou, Wen-Jing;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：71/0  |  提交时间：2019/12/10
	pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2019, 卷号: 18, 期号: 7, 页码: 2747-2758 作者:  Zhou, Wen-Jing;  Yang, Hao;  Zeng, Wen-Feng;  Zhang, Kun;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：247/0  |  提交时间：2019/08/16 tandem mass spectrometry  target-decoy approach  validation methods  false-positive rate  false-negative rate
	pDeep: Predicting MS/MS Spectra of Peptides with Deep Learning 期刊论文 ANALYTICAL CHEMISTRY, 2017, 卷号: 89, 期号: 23, 页码: 12690-12697 作者:  Zhou, Xie-Xuan;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  Luo, Chunjie;  Liu, Chao;  Zhan, Jianfeng;  He, Si-Min;  Zhang, Zhifei 收藏  |  浏览/下载：67/0  |  提交时间：2019/12/10
	pTop 1.0: A High-Accuracy and High-Efficiency Search Engine for Intact Protein Identification 期刊论文 ANALYTICAL CHEMISTRY, 2016, 卷号: 88, 期号: 6, 页码: 3082-3090 作者:  Sun, Rui-Xiang;  Luo, Lan;  Wu, Long;  Wang, Rui-Min;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  Liu, Chao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：57/0  |  提交时间：2019/12/13