扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测

	扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测
	李泽 1; 王松建 2; 杨涛 3; 李旭 4; 郭衍志 1; 但芸婕 1; 徐宝艳 1; 邓国宏 1
	2016
发表期刊	第三军医大学学报
ISSN	1000-5404
卷号	38 期号:13 页码:1471
摘要	目的建立一种快速准确检测扎伊尔型埃博拉病毒(Zaire ebola virus,ZEBOV)的方法。方法以2014年西非新分离的3株ZEBOV全基因组参考序列及1976年从Mayinga分离的ZEBOV株(NC_002549)为目标,基于Insignia系统算法与GenBank中Nt库比对,求出ZEBOV特异性核酸标签序列。设计引物、Taq Man探针和优化反应条件,以10倍系列稀释的阳性质粒做标准曲线,做准确性、重复性实验。并以其余4个亚型的埃博拉病毒、马尔堡病毒、西尼罗河热病毒、东方马脑炎病毒、西方马脑炎病毒等8种病毒对照及临床48例患者复杂样本为对照做特异性检测。结果选择比对得到的特异性标签序列(KJ660348,11331-11514)设计探针引物,标准曲线相关系数>0.99,灵敏度可达5×10~1拷贝。准确性重复性实验结果批内变异系数(CV)为0.88%~2.50%、批间CV为1.75%~3.31%。8种病毒及临床48例患者复杂样本对照均为阴性。结论ZEBOV核酸标签(KJ660348,11331-11514)在非编码区,在此基础上建立的荧光定量PCR方法可特异性检测ZEBOV,且灵敏、重复性好。
关键词	扎伊尔型埃博拉病毒荧光定量PCR 标签序列鉴定
语种	英语
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/34684
专题	中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文
作者单位	1.第三军医大学西南医院全军感染病研究所 2.重庆大学计算机学院 3.解放军77128部队 4.中国科学院计算技术研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	李泽,王松建,杨涛,等. 扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测[J]. 第三军医大学学报,2016,38(13):1471.
APA	李泽.,王松建.,杨涛.,李旭.,郭衍志.,...&邓国宏.(2016).扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测.第三军医大学学报,38(13),1471.
MLA	李泽,et al."扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测".第三军医大学学报 38.13(2016):1471.