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肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用
孙瑞祥1; 贺思敏1; 刘超2; 王海鹏2; 付岩1; 袁作飞2; 迟浩2; 王乐珩1
2010
发表期刊色谱
ISSN1000-8713
卷号28.0期号:006页码:529
摘要液相色谱-质谱(LC-MS)联用是当今规模化蛋白质鉴定的主流技术。肽段在反相液相色谱(RPLC)中的保留时间主要是由肽段的理化性质和LC条件(固定相、流动相)决定的。可以通过分析肽段的理化性质,并量化它们对肽段色谱行为的影响来预测保留时间。预测结果可以用于帮助提高蛋白质鉴定的数量和可信度,也可用于肽段的翻译后修饰等研究。现在已有的保留时间预测算法主要有保留系数法和机器学习法两大类,得到的预测保留时间与实际保留时间相关系数可达到0.93。随着色谱和质谱技术的不断发展,肽段色谱行为的稳定性和重现性越来越好,保留时间预测结果也越来越准确。预测肽段保留时间将成为提高蛋白质鉴定结果的重要技术手段之一。
关键词反相液相色谱-质谱联用 保留系数 机器学习 保留时间 预测 蛋白质 鉴定
语种英语
文献类型期刊论文
条目标识符http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/34616
专题中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文
作者单位1.中国科学院计算技术研究所
2.中国科学院大学
第一作者单位中国科学院计算技术研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
孙瑞祥,贺思敏,刘超,等. 肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用[J]. 色谱,2010,28.0(006):529.
APA 孙瑞祥.,贺思敏.,刘超.,王海鹏.,付岩.,...&王乐珩.(2010).肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用.色谱,28.0(006),529.
MLA 孙瑞祥,et al."肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用".色谱 28.0.006(2010):529.
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