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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Accelerating k-Shape Time Series Clustering Algorithm Using GPU
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS, 2023, 卷号: 34, 期号: 10, 页码: 2718-2734
作者:
Wang, Xun
;
Song, Ruibao
;
Xiao, Junmin
;
Li, Tong
;
Li, Xueqi
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提交时间:2023/12/04
Data space
time series analysis
time series clustering
GPU architecture
k-shape algorithm
Spark-based parallel calculation of 3D fourier shell correlation for macromolecule structure local resolution estimation
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 页码: 18
作者:
Lue, Yongchun
;
Zeng, Xiangrui
;
Tian, Xinhui
;
Shi, Xiao
;
Wang, Hui
;
Zheng, Xiaohui
;
Liu, Xiaodong
;
Zhao, Xiaofang
;
Gao, Xin
;
Xu, Min
收藏
  |  
浏览/下载:55/0
  |  
提交时间:2020/12/10
3D local Fourier shell correlation
3D local resolution map
Key-value data
Spark
3D array partition
PIXER: an automated particle-selection method based on segmentation using a deep neural network
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 14
作者:
Zhang, Jingrong
;
Wang, Zihao
;
Chen, Yu
;
Han, Renmin
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:78/0
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提交时间:2019/04/03
Cryo-electron microscope
Single-particle analysis
Deep learning
Particle selection
Segmentation
A local-optimization refinement algorithm in single particle analysis for macromolecular complex with multiple rigid modules
期刊论文
PROTEIN & CELL, 2016, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 46-62
作者:
Shan, Hong
;
Wang, Zihao
;
Zhang, Fa
;
Xiong, Yong
;
Yin, Chang-Cheng
;
Sun, Fei
收藏
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2019/12/13
cryo-electron microscopy
single particle analysis
conformational heterogeneity
rigid module
local optimization refinement