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PIM-Align: A Processing-in-Memory Architecture for FM-Index Search Algorithm 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2021, 卷号: 36, 期号: 1, 页码: 56-70
作者:  Li, Xue-Qi;  Tan, Guang-Ming;  Sun, Ning-Hui
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accelerator design  genomic sequence alignment  near-memory computing  
Dawning Nebulae: A PetaFLOPS Supercomputer with a Heterogeneous Structure 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2011, 卷号: 26, 期号: 3, 页码: 352-362
作者:  Sun, Ning-Hui;  Xing, Jing;  Huo, Zhi-Gang;  Tan, Guang-Ming;  Xiong, Jin;  Li, Bo;  Ma, Can
收藏  |  浏览/下载：83/0  |  提交时间：2019/12/16
supercomputer  heterogeneous systems  performance evaluation  
Improvement of performance of MegaBlast algorithm for DNA sequence alignment 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2006, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 973-978
作者:  Tan, Guang-Ming;  Xu, Lin;  Bu, Dong-Bo;  Feng, Sheng-Zhong;  Sun, Ning-Hui
收藏  |  浏览/下载：55/0  |  提交时间：2019/12/16
sequence alignment  BLAST  MegaBlast  I/O intensive  parallelization