中国科学院计算技术研究所机构知识库

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	ESA: An efficient sequence alignment algorithm for biological database search on Sunway TaihuLight 期刊论文 PARALLEL COMPUTING, 2023, 卷号: 117, 页码: 11 作者:  Zhang, Hao;  Huang, Zhiyi;  Chen, Yawen;  Liang, Jianguo;  Gao, Xiran 收藏  |  浏览/下载：16/0  |  提交时间：2023/12/04 Hybrid sequence alignment  Biological database search  Sunway TaihuLight  SW26010  Heterogeneous architecture
	PIM-Align: A Processing-in-Memory Architecture for FM-Index Search Algorithm 期刊论文 JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2021, 卷号: 36, 期号: 1, 页码: 56-70 作者:  Li, Xue-Qi;  Tan, Guang-Ming;  Sun, Ning-Hui 收藏  |  浏览/下载：45/0  |  提交时间：2021/12/01 accelerator design  genomic sequence alignment  near-memory computing
	A study of architectural optimization methods in bioinformatics applications 期刊论文 INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS, 2007, 卷号: 21, 期号: 3, 页码: 371-384 作者:  Tan, G.;  Xu, L.;  Dai, Z.;  Fong, S.;  Sun, N. 收藏  |  浏览/下载：43/0  |  提交时间：2019/12/16 bioinformatics  sequence alignment  cache memory  instruction level parallelism  I/O overlapping
	Survey on index based homology search algorithms 期刊论文 JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, 2007, 卷号: 40, 期号: 2, 页码: 185-212 作者:  Jiang, Xianyang;  Zhang, Peiheng;  Liu, Xinchun;  Yau, Stephen S-T. 收藏  |  浏览/下载：41/0  |  提交时间：2019/12/16 algorithm  bioinformatics  genomic indexing  homology search  sequence alignment
	Improvement of performance of MegaBlast algorithm for DNA sequence alignment 期刊论文 JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2006, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 973-978 作者:  Tan, Guang-Ming;  Xu, Lin;  Bu, Dong-Bo;  Feng, Sheng-Zhong;  Sun, Ning-Hui 收藏  |  浏览/下载：61/0  |  提交时间：2019/12/16 sequence alignment  BLAST  MegaBlast  I/O intensive  parallelization
	无权访问的条目 期刊论文 作者:  Guang-Ming Tan（谭光明）;  Lin Xu（徐琳）;  Dong-Bo Bu（卜东波）;  Sheng-Zhong Feng（冯圣中）;  Ning-Hui Sun（孙凝晖） Adobe PDF(360Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：0/0  |  提交时间：2010/11/04
	Parallel divide and conquer bio-sequence comparison based on Smith-Waterman algorithm 期刊论文 SCIENCE IN CHINA SERIES F-INFORMATION SCIENCES, 2004, 卷号: 47, 期号: 2, 页码: 221-231 作者:  Zhang, F;  Qiao, XZ;  Liu, ZY 收藏  |  浏览/下载：75/0  |  提交时间：2019/12/16 biological sequence alignment  dynamic programming  divide and conquer  parallel