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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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PIM-Align: A Processing-in-Memory Architecture for FM-Index Search Algorithm
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2021, 卷号: 36, 期号: 1, 页码: 56-70
作者:
Li, Xue-Qi
;
Tan, Guang-Ming
;
Sun, Ning-Hui
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提交时间:2021/12/01
accelerator design
genomic sequence alignment
near-memory computing
Survey on index based homology search algorithms
期刊论文
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, 2007, 卷号: 40, 期号: 2, 页码: 185-212
作者:
Jiang, Xianyang
;
Zhang, Peiheng
;
Liu, Xinchun
;
Yau, Stephen S-T.
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提交时间:2019/12/16
algorithm
bioinformatics
genomic indexing
homology search
sequence alignment