中国科学院计算技术研究所机构知识库

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	Evaluation of CircRNA sequence assembly methods using long reads (vol 13, 816825, 2022) 期刊论文 FRONTIERS IN GENETICS, 2023, 卷号: 14, 页码: 1 作者:  Zhang, Jingjing;  Hossain, Md. Tofazzal;  Liu, Weiguo;  Peng, Yin;  Pan, Yi;  Wei, Yanjie 收藏  |  浏览/下载：14/0  |  提交时间：2023/12/04 circRNA  full-length sequences  short reads  long reads  assembly
	Evaluation of CircRNA Sequence Assembly Methods Using Long Reads 期刊论文 FRONTIERS IN GENETICS, 2022, 卷号: 13, 页码: 12 作者:  Zhang, Jingjing;  Hossain, Md. Tofazzal;  Liu, Weiguo;  Peng, Yin;  Pan, Yi;  Wei, Yanjie 收藏  |  浏览/下载：23/0  |  提交时间：2022/12/07 circRNA  full-length sequences  short reads  long reads  assembly
	Filling gaps of genome scaffolds via probabilistic searching optical maps against assembly graph 期刊论文 BMC Bioinformatics, 2021, 卷号: 22, 期号: 1 作者:  Huang,Bin;  Wei,Guozheng;  Wang,Bing;  Ju,Fusong;  Zhong,Yi;  Shi,Zhuozheng;  Sun,Shiwei;  Bu,Dongbo 收藏  |  浏览/下载：45/0  |  提交时间：2021/12/01 Genome assembly  Gap filling  Scaffolding  Optical maps  Probabilistic search
	Single-cell Long Non-coding RNA Landscape of T Cells in Human Cancer Immunity 期刊论文 GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 377-393 作者:  Luo, Haitao;  Bu, Dechao;  Shao, Lijuan;  Li, Yang;  Sun, Liang;  Wang, Ce;  Wang, Jing;  Yang, Wei;  Yang, Xiaofei;  Dong, Jun;  Zhao, Yi;  Li, Furong 收藏  |  浏览/下载：27/0  |  提交时间：2022/12/07 Long non-coding RNA  Transcriptome assembly  Metacell  Immune regulation  Functional annotation
	SWAP-Assembler: scalable and efficient genome assembly towards thousands of cores 期刊论文 BMC Bioinformatics, 2014, 卷号: 15, 期号: Suppl 9 作者:  Meng,Jintao;  Wang,Bingqiang;  Wei,Yanjie;  Feng,Shengzhong;  Balaji,Pavan 收藏  |  浏览/下载：52/0  |  提交时间：2019/08/16 genome assembly  parallel computing  De Bruijn graph
	Molecular logic computing model based on self-assembly of DNA nanoparticles 期刊论文 CHINESE SCIENCE BULLETIN, 2011, 卷号: 56, 期号: 33, 页码: 3566-3571 作者:  Zhang Cheng;  Yang Jing;  Xu Jin 收藏  |  浏览/下载：68/0  |  提交时间：2019/12/16 logic computing  DNA computing  nanoparticle  DNA self-assembly
	Fragment-HMM: A new approach to protein structure prediction 期刊论文 PROTEIN SCIENCE, 2008, 卷号: 17, 期号: 11, 页码: 1925-1934 作者:  Li, Shuai Cheng;  Bu, Dongbo;  Xu, Jinbo;  Li, Ming 收藏  |  浏览/下载：45/0  |  提交时间：2019/12/16 protein structure prediction  hidden Markov model  fragment assembly