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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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Equivariance is essential, local representation is a need: A comprehensive and critical study of machine learning potentials for tobermorite phases
期刊论文
COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE, 2025, 卷号: 246, 页码: 14
作者:
Zhu, Keming
;
Zhang, Zhibin
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提交时间:2024/12/06
Machine learning potential
Tobermorite
Density functional theory
Molecular dynamics
An Integrated Deep Learning and Molecular Dynamics Simulation-Based Screening Pipeline Identifies Inhibitors of a New Cancer Drug Target TIPE2
期刊论文
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2021, 卷号: 12, 页码: 13
作者:
Zhang, Haiping
;
Li, Junxin
;
Saravanan, Konda Mani
;
Wu, Hao
;
Wang, Zhichao
;
Wu, Du
;
Wei, Yanjie
;
Lu, Zhen
;
Chen, Youhai H.
;
Wan, Xiaochun
;
Pan, Yi
收藏
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提交时间:2022/06/21
TIPE2
UM-164
virtual screening
deep learning
molecular dynamics simulation
Long-term behavior of vacancy defects in Pu-Ga alloy: Effects of temperature and Ga concentration
期刊论文
COMPUTATIONAL AND THEORETICAL CHEMISTRY, 2021, 卷号: 1204, 页码: 10
作者:
Xu, Lei
;
Wang, Li-Fang
;
Chen, Xin
;
Gao, Xing-Yu
;
Shang, Hong-Hui
;
Liu, Hai-Feng
;
Song, Hai-Feng
收藏
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浏览/下载:46/0
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提交时间:2021/12/01
Vacancy defects
Dynamical evolution
Pu-Ga alloy
Actinide metals
Atomistic kinetic Monte Carlo
Molecular dynamics
Structural basis for the inhibition of SARS-CoV2 main protease by Indian medicinal plant-derived antiviral compounds
期刊论文
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2020, 页码: 9
作者:
Saravanan, Konda Mani
;
Zhang, Haiping
;
Senthil, Renganathan
;
Vijayakumar, Kevin Kumar
;
Sounderrajan, Vignesh
;
Wei, Yanjie
;
Shakila, Harshavardhan
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提交时间:2020/12/10
SARS-CoV2
main protease
medicinal plants
molecular docking and dynamics
drug design
FastNBL: fast neighbor lists establishment for molecular dynamics simulation based on bitwise operations
期刊论文
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, 2020, 卷号: 76, 期号: 7, 页码: 5501-5520
作者:
Li, Kun
;
Li, Shigang
;
Huang, Shan
;
Chen, Yifeng
;
Zhang, Yunquan
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浏览/下载:58/0
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提交时间:2020/12/10
Neighbor list
Bitwise operations
SIMD
Molecular dynamics
Kernel optimization for short-range molecular dynamics
期刊论文
COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 2017, 卷号: 211, 页码: 31-40
作者:
Hu Changjun
;
Wang Xianmeng
;
Li Jianjiang
;
He Xinfu
;
Li Shigang
;
Feng Yangde
;
Yang Shaofeng
;
Bai He
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提交时间:2019/12/12
Molecular Dynamics
OpenMP
SIMD
MIC