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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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ExomiRHub: A comprehensive database for hosting and analyzing human disease-related extracellular microRNA transcriptomics data
期刊论文
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2024, 卷号: 23, 页码: 3104-3116
作者:
Liu, Yang
;
Min, Zhuochao
;
Mo, Jing
;
Ju, Zhen
;
Chen, Jianliang
;
Liang, Weiling
;
Zhang, Lantian
;
Li, Hanguang
;
Chan, Godfrey Chi-Fung
;
Wei, Yanjie
;
Zhang, Wenliang
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提交时间:2024/12/06
MiRNA
Extracellular vesicle
Exosome
Cancer
Liquid biopsy
Attention-Guided Residual U-Net with SE Connection and ASPP for Watershed-Based Cell Segmentation in Microscopy Images
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2024, 页码: 13
作者:
Niyogisubizo, Jovial
;
Zhao, Keliang
;
Meng, Jintao
;
Pan, Yi
;
Didi, Rosiy Adi
;
Wei, Yanjie
收藏
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提交时间:2024/12/06
cell segmentation
deep learning
watershed segmentation
bright-field microscopy
iPS cell reprogramming
attention mechanism
A new paradigm for applying deep learning to protein-ligand interaction prediction
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2024, 卷号: 25, 期号: 3, 页码: 12
作者:
Wang, Zechen
;
Wang, Sheng
;
Li, Yangyang
;
Guo, Jingjing
;
Wei, Yanjie
;
Mu, Yuguang
;
Zheng, Liangzhen
;
Li, Weifeng
收藏
  |  
浏览/下载:2/0
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提交时间:2024/12/06
protein-ligand interaction
scoring function
deep learning
graph neural network
Design,
in
silico
evaluation, and
in
vitro
verification of new bivalent Smac mimetics with pro-apoptotic activity
期刊论文
METHODS, 2024, 卷号: 224, 页码: 35-46
作者:
Huang, Qingsheng
;
Peng, Yin
;
Peng, Yuefeng
;
Lin, Huijuan
;
Deng, Shiqi
;
Feng, Shengzhong
;
Wei, Yanjie
收藏
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浏览/下载:2/0
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提交时间:2024/12/06
XIAP
Apoptosis
Antagonist
Smac mimetic
Caspase-3
Caspase-9
Evaluation of CircRNA sequence assembly methods using long reads (vol 13, 816825, 2022)
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2023, 卷号: 14, 页码: 1
作者:
Zhang, Jingjing
;
Hossain, Md. Tofazzal
;
Liu, Weiguo
;
Peng, Yin
;
Pan, Yi
;
Wei, Yanjie
收藏
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提交时间:2023/12/04
circRNA
full-length sequences
short reads
long reads
assembly
Identification of circRNA biomarker for gastric cancer through integrated analysis (vol 9, 857320, 2022)
期刊论文
FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, 2023, 卷号: 10, 页码: 2
作者:
Hossain, Md. Tofazzal
;
Li, Song
;
Reza, Md. Selim
;
Feng, Shengzhong
;
Zhang, Xiaojing
;
Jin, Zhe
;
Wei, Yanjie
;
Peng, Yin
收藏
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浏览/下载:15/0
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提交时间:2023/12/04
gastric cancer
circular RNA
computational approach
circRNA biomarker
circRNA-miRNA-gene interaction