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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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A note on the false discovery rate of novel peptides in proteogenomics
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2015, 卷号: 31, 期号: 20, 页码: 3249-3253
作者:
Zhang, Kun
;
Fu, Yan
;
Zeng, Wen-Feng
;
He, Kun
;
Chi, Hao
;
Liu, Chao
;
Li, Yan-Chang
;
Gao, Yuan
;
Xu, Ping
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/13
pFind-Alioth: A novel unrestricted database search algorithm to improve the interpretation of high-resolution MS/MS data
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOMICS, 2015, 卷号: 125, 页码: 89-97
作者:
Chi, Hao
;
He, Kun
;
Yang, Bing
;
Chen, Zhen
;
Sun, Rui-Xiang
;
Fan, Sheng-Bo
;
Zhang, Kun
;
Liu, Chao
;
Yuan, Zuo-Fei
;
Wang, Quan-Hui
;
Liu, Si-Qi
;
Dong, Meng-Qiu
;
He, Si-Min
收藏
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提交时间:2019/12/13
Unrestricted database search
Ion index
In-depth interpretation
High resolution MS/MS
DeltAMT: A Statistical Algorithm for Fast Detection of Protein Modifications From LC-MS/MS Data
期刊论文
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, 2011, 卷号: 10, 期号: 5, 页码: 15
作者:
Fu, Yan
;
Xiu, Li-Yun
;
Jia, Wei
;
Ye, Ding
;
Sun, Rui-Xiang
;
Qian, Xiao-Hong
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/16
Improved Peptide Identification for Proteomic Analysis Based on Comprehensive Characterization of Electron Transfer Dissociation Spectra
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2010, 卷号: 9, 期号: 12, 页码: 6354-6367
作者:
Sun, Rui-Xiang
;
Dong, Meng-Qiu
;
Song, Chun-Qing
;
Chi, Hao
;
Yang, Bing
;
Xiu, Li-Yun
;
Tao, Li
;
Jing, Ziu-Yi
;
Liu, Chao
;
Wang, Le-Heng
;
Fu, Yan
;
He, Si-Min
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浏览/下载:68/0
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提交时间:2019/12/16
ETD
hydrogen rearrangement
peptide sequencing
search engine
Open MS/MS spectral library search to identify unanticipated post-translational modifications and increase spectral identification rate
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 26, 期号: 12, 页码: i399-i406
作者:
Ye, Ding
;
Fu, Yan
;
Sun, Rui-Xiang
;
Wang, Hai-Peng
;
Yuan, Zuo-Fei
;
Chi, Hao
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/16
An efficient parallelization of phosphorylated peptide and protein identification
期刊论文
RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY, 2010, 卷号: 24, 期号: 12, 页码: 1791-1798
作者:
Wang, Leheng
;
Wang, Wenping
;
Chi, Hao
;
Wu, Yanjie
;
Li, You
;
Fu, Yan
;
Zhou, Chen
;
Sun, Ruixiang
;
Wang, Haipeng
;
Liu, Chao
;
Yuan, Zuofei
;
Xiu, Liyun
;
He, Si-Min
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提交时间:2019/12/16
pNovo: De novo Peptide Sequencing and Identification Using HCD Spectra
期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2010, 卷号: 9, 期号: 5, 页码: 2713-2724
作者:
Chi, Hao
;
Sun, Rui-Xiang
;
Yang, Bing
;
Song, Chun-Qing
;
Wang, Le-Heng
;
Liu, Chao
;
Fu, Yan
;
Yuan, Zuo-Fei
;
Wang, Hai-Peng
;
He, Si-Min
;
Dong, Meng-Qiu
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提交时间:2019/12/16
tandem mass spectrometry
HCD
de novo sequencing
pNovo