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中国科学院计算技术研究所机构知识库
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SASA-Net: A Spatial-Aware Self-Attention Mechanism for Building Protein 3D Structure Directly From Inter- Residue Distances
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 20, 期号: 6, 页码: 3482-3488
作者:
Gong, Tiansu
;
Ju, Fusong
;
Sun, Shiwei
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2024/05/20
Deep learning
protein structure prediction
FALCON2: a web server for high-quality prediction of protein tertiary structures
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 14
作者:
Kong, Lupeng
;
Ju, Fusong
;
Zhang, Haicang
;
Sun, Shiwei
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2021/12/01
Protein structure prediction
Template-based modeling
Ab initio prediction
Protein structure prediction web service
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 10
作者:
Wang, Chao
;
Wei, Yi
;
Zhang, Haicang
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
;
Zheng, Wei-Mou
;
Bu, Dongbo
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提交时间:2019/08/16
Protein structure prediction
Energy function
Attraction-basin
Reverse Monte Carlo sampling
Monte Carlo search
Linear program
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学位论文
作者:
李慧
Adobe PDF(3423Kb)
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提交时间:2018/07/02
Construction of ground-state preserving sparse lattice models for predictive materials simulations
期刊论文
NPJ COMPUTATIONAL MATERIALS, 2017, 卷号: 3, 页码: 9
作者:
Huang, Wenxuan
;
Urban, Alexander
;
Rong, Ziqin
;
Ding, Zhiwei
;
Luo, Chuan
;
Ceder, Gerbrand
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提交时间:2019/12/10
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学位论文
作者:
王超
Adobe PDF(5852Kb)
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提交时间:2016/06/24
无权访问的条目
学位论文
作者:
巩海娥
Adobe PDF(3913Kb)
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提交时间:2016/06/28
COMSAT: Residue contact prediction of transmembrane proteins based on support vector machines and mixed integer linear programming
期刊论文
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 84, 期号: 3, 页码: 332-348
作者:
Zhang, Huiling
;
Huang, Qingsheng
;
Bei, Zhendong
;
Wei, Yanjie
;
Floudas, Christodoulos A.
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提交时间:2019/12/13
protein structure prediction
hybrid framework
machine learning
ab initio prediction
MILP
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学位论文
作者:
张昆
Adobe PDF(6394Kb)
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提交时间:2016/01/28
无权访问的条目
学位论文
作者:
卜德超
Adobe PDF(5265Kb)
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提交时间:2015/07/13