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Confident software-driven identification of intact glycopeptides by integrating complementary peptide- and glycan-first search strategies in efficient mining of MS2 data 期刊论文
GLYCOBIOLOGY, 2021, 卷号: 31, 期号: 12, 页码: 1725-1726
作者:  Chien, Yu-Chun;  Kuo, Chu-Wei;  Zeng, Wen-Feng;  Khoo, Kay-Hooi
收藏  |  浏览/下载：18/0  |  提交时间：2022/12/07
Precise, fast and comprehensive analysis of intact glycopeptides and modified glycans with pGlyco3 期刊论文
NATURE METHODS, 2021, 页码: 15
作者:  Zeng, Wen-Feng;  Cao, Wei-Qian;  Liu, Ming-Qi;  He, Si-Min;  Yang, Peng-Yuan
收藏  |  浏览/下载：29/0  |  提交时间：2022/06/21
pDeepXL: MS/MS Spectrum Prediction for Cross-Linked Peptide Pairs by Deep Learning 期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2021, 卷号: 20, 期号: 5, 页码: 2570-2582
作者:  Chen, Zhen-Lin;  Mao, Peng-Zhi;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  He, Si-Min
收藏  |  浏览/下载：39/0  |  提交时间：2021/12/01
cross-linking mass spectrometry  spectrum prediction  deep learning  transfer learning  online fine-tuning  
pDeep3: Toward More Accurate Spectrum Prediction with Fast Few-Shot Learning 期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2021, 卷号: 93, 期号: 14, 页码: 5815-5822
作者:  Tarn, Ching;  Zeng, Wen-Feng
收藏  |  浏览/下载：31/0  |  提交时间：2021/12/01