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中国科学院计算技术研究所机构知识库
Institute of Computing Technology, Chinese Academy IR
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作者:Zhang, Fa分Zhang, Fa
作者:Liu, Zhiyong
第一作者
作者:Wang, Zihao
作者:Zhang, Fa
资助项目:NSFC[U1611261]
资助项目:NSFC[U1611263]
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Improve the Resolution and Parallel Performance of the Three-Dimensional Refine Algorithm in RELION Using CUDA and MPI
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 18, 期号: 2, 页码: 583-595
作者:
Zhang, Jingrong
;
Wang, Zihao
;
Liu, Zhiyong
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:38/0
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提交时间:2021/12/01
Memory management
Graphics processing units
Arrays
Statistical analysis
Three-dimensional displays
cryoEM
RELION
CUDA
statistical method
Top-k selection
A Consensus Framework of Distributed Multiple-Tilt Reconstruction in Electron Tomography
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 页码: 11
作者:
Wang, Zihao
;
Zhang, Jingrong
;
Gao, Weifang
;
Liu, Zhiyong
;
Wan, Xiaohua
;
Zhang, Fa
收藏
  |  
浏览/下载:46/0
  |  
提交时间:2020/12/10
consensus optimization
cryoelectron tomography
multiple-tilt reconstruction
parallel computing
TxBR
PIXER: an automated particle-selection method based on segmentation using a deep neural network
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 14
作者:
Zhang, Jingrong
;
Wang, Zihao
;
Chen, Yu
;
Han, Renmin
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:77/0
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提交时间:2019/04/03
Cryo-electron microscope
Single-particle analysis
Deep learning
Particle selection
Segmentation
ICON-MIC: Implementing a CPU/MIC Collaboration Parallel Framework for ICON on Tianhe-2 Supercomputer
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2017, 页码: 12
作者:
Wang, Zihao
;
Chen, Yu
;
Zhang, Jingrong
;
Li, Lun
;
Wan, Xiaohua
;
Liu, Zhiyong
;
Sun, Fei
;
Zhang, Fa
收藏
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浏览/下载:61/0
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提交时间:2019/12/10
electron tomography
hybrid task allocation strategy
ICON
MIC acceleration
parallel NUFFT
Tianhe-2 supercomputer