中国科学院计算技术研究所机构知识库

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限定条件	出处：JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

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	pDeepXL: MS/MS Spectrum Prediction for Cross-Linked Peptide Pairs by Deep Learning 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2021, 卷号: 20, 期号: 5, 页码: 2570-2582 作者:  Chen, Zhen-Lin;  Mao, Peng-Zhi;  Zeng, Wen-Feng;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：39/0  |  提交时间：2021/12/01 cross-linking mass spectrometry  spectrum prediction  deep learning  transfer learning  online fine-tuning
	pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2019, 卷号: 18, 期号: 7, 页码: 2747-2758 作者:  Zhou, Wen-Jing;  Yang, Hao;  Zeng, Wen-Feng;  Zhang, Kun;  Chi, Hao;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：247/0  |  提交时间：2019/08/16 tandem mass spectrometry  target-decoy approach  validation methods  false-positive rate  false-negative rate
	pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2018, 卷号: 17, 期号: 1, 页码: 119-128 作者:  Yang, Hao;  Chi, Hao;  Zhou, Wen-Jing;  Zeng, Wen-Feng;  Liu, Chao;  Wang, Rui-Min;  Wang, Zhao-Wei;  Niu, Xiu-Nan;  Chen, Zhen-Lin;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：71/0  |  提交时间：2019/12/10 tandem mass spectrometry  de novo peptide sequencing  modification site localization  phosphorylation
	Open-pNovo: De Novo Peptide Sequencing with Thousands of Protein Modifications 期刊论文 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2017, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 645-654 作者:  Yang, Hao;  Chi, Hao;  Zhou, Wen-Jing;  Zeng, Wen-Feng;  He, Kun;  Liu, Chao;  Sun, Rui-Xiang;  He, Si-Min 收藏  |  浏览/下载：50/0  |  提交时间：2019/12/12 tandem mass spectrometry  de novo peptide sequencing  dynamic programming  unexpected modifications