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基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析
齐震1; 狐昱2; 李蔚1; 陈燕俊1; 张治华1; 孙世伟2; 卢宏超2; 张京芬2; 卜东波2; 凌伦奖1; 陈润生1
2003
发表期刊科学通报
ISSN0023-074X
卷号48.0期号:012页码:1242
摘要SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒已被世界卫生组织确认为SARS传染病的病原体,它的全基因组测序工作分别由中国、加拿大、美国等国的研究小组完成.然而它的起源仍是一个谜.为了探寻SARS冠状病毒的来源,基于FDOD(function Of degree of disagreement)方法,对12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒进行了全基因组比较,构造出种系进化无根树.结果表明,这两类病毒(分别由12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒构成)虽然都来自冠状病毒属,但它们位于两个不同的进化分支上.冠状病毒属中的3个组被准确地重构.根据得到的结果,推测SARS冠状病毒更类似于第一组中的冠状病毒.根据种系进化树的拓扑结构和各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系,推测各SARS冠状病毒分离株分别位于进化树上两个大的分支,这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息.
关键词SARS冠状病毒 种系进化 传染途径 FDOD
语种英语
文献类型期刊论文
条目标识符http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/37426
专题中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文
作者单位1.中国科学院生物物理研究所
2.中国科学院计算技术研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
齐震,狐昱,李蔚,等. 基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析[J]. 科学通报,2003,48.0(012):1242.
APA 齐震.,狐昱.,李蔚.,陈燕俊.,张治华.,...&陈润生.(2003).基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析.科学通报,48.0(012),1242.
MLA 齐震,et al."基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析".科学通报 48.0.012(2003):1242.
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