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基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究
任菲1; 张法2; 张阳德1
2012
发表期刊中国现代医学杂志
ISSN1005-8982
页码15
摘要目的探讨直系同源蛋白质聚类分析的方法,为高效、快速的直系同源蛋白质聚类分析研究提供有效帮助。方法基于蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,提出一种直系同源蛋白质聚类方法,实现了直系同源蛋白质的快速、精确聚类。结果对人类、酵母、蠕虫、果蝇、拟南芥和斑马鱼等六种真核生物序列直系同源蛋白质的聚类分析,结果明显优于NCBI和TIGR的聚类结果。结论利用蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,可以有效筛选出假的同源关系,进而显著提高直系同源蛋白聚类的精确性和紧密性。
关键词结构域 同源直系 聚类 真核生物
语种英语
文献类型期刊论文
条目标识符http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/36454
专题中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文
作者单位1.中南大学
2.中国科学院计算技术研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
任菲,张法,张阳德. 基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究[J]. 中国现代医学杂志,2012:15.
APA 任菲,张法,&张阳德.(2012).基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究.中国现代医学杂志,15.
MLA 任菲,et al."基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究".中国现代医学杂志 (2012):15.
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