| 基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究 |
| 任菲1; 张法2; 张阳德1
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| 2012
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发表期刊 | 中国现代医学杂志
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ISSN | 1005-8982
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页码 | 15 |
摘要 | 目的探讨直系同源蛋白质聚类分析的方法,为高效、快速的直系同源蛋白质聚类分析研究提供有效帮助。方法基于蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,提出一种直系同源蛋白质聚类方法,实现了直系同源蛋白质的快速、精确聚类。结果对人类、酵母、蠕虫、果蝇、拟南芥和斑马鱼等六种真核生物序列直系同源蛋白质的聚类分析,结果明显优于NCBI和TIGR的聚类结果。结论利用蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,可以有效筛选出假的同源关系,进而显著提高直系同源蛋白聚类的精确性和紧密性。 |
关键词 | 结构域
同源直系
聚类
真核生物
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语种 | 英语
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文献类型 | 期刊论文
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条目标识符 | http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/36454
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专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文
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作者单位 | 1.中南大学 2.中国科学院计算技术研究所
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推荐引用方式 GB/T 7714 |
任菲,张法,张阳德. 基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究[J]. 中国现代医学杂志,2012:15.
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APA |
任菲,张法,&张阳德.(2012).基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究.中国现代医学杂志,15.
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MLA |
任菲,et al."基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究".中国现代医学杂志 (2012):15.
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