Institute of Computing Technology, Chinese Academy IR
基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现 | |
詹科1; 张云泉2; 王婷1; 郑晶晶1; 张鹏1 | |
2015 | |
发表期刊 | 计算机科学 |
ISSN | 1002-137X |
卷号 | 42.0期号:1.0页码:90 |
摘要 | 高通量测序仪产生大量的DNA数据,FASTQ是被广泛使用的存储DNA数据的数据格式.对FASTQ格式的数据进行压缩处理,能有效地节省存储空间.DSRC算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC算法进行并行能提高压缩FASTQ格式的DNA数据的效率.基于Pthreads,实现了并行DSRC算法.测试结果表明,当使用4线程时加速比达到3.5. |
关键词 | FASTQ 数据压缩 DSRC Pthreads |
语种 | 英语 |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/34884 |
专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
作者单位 | 1.中国科学院软件研究所 2.中国科学院计算技术研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 詹科,张云泉,王婷,等. 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现[J]. 计算机科学,2015,42.0(1.0):90. |
APA | 詹科,张云泉,王婷,郑晶晶,&张鹏.(2015).基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现.计算机科学,42.0(1.0),90. |
MLA | 詹科,et al."基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现".计算机科学 42.0.1.0(2015):90. |
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