Institute of Computing Technology, Chinese Academy IR
| 一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现 | |
| 张佩珩; 刘新春; 江先阳 | |
| 2005 | |
| 发表期刊 | 计算机研究与发展
 |
| ISSN | 1000-1239 |
| 卷号 | 42.0期号:006页码:930 |
| 摘要 | 人类基因组测序工作完成后，对基因数据的处理和分析能力提出了更高的要求．生物信息学的基本研究方法之一就是计算，其算法的特点是数据量较大、算法比较简单、运算类型单一、重复性较强、潜在的并行度较高．用现有的大规模并行机或超级服务器等通用系统解决这些问题，既浪费系统的资源，使用维护也比较复杂，有些问题甚至无法在限定的时间内完成．提出了一种。比较通用的算法可重构硬件加速卡的体系结构，以全局Smith-Waterman算法为例，阐述了从算法到硬件实现的映射过程，并指出了将其他类型算法映射到该加速卡上的可行性． |
| 关键词 | 全局Smith-Waterman算法 可重构 硬件加速卡 FPGA |
| 语种 | 英语 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.204/handle/2XEOYT63/29777 |
| 专题 | 中国科学院计算技术研究所期刊论文_中文 |
| 作者单位 | 中国科学院计算技术研究所 |
| 第一作者单位 | 中国科学院计算技术研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张佩珩,刘新春,江先阳. 一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现[J]. 计算机研究与发展,2005,42.0(006):930. |
| APA | 张佩珩,刘新春,&江先阳.(2005).一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现.计算机研究与发展,42.0(006),930. |
| MLA | 张佩珩,et al."一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现".计算机研究与发展 42.0.006(2005):930. |
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